Vad är skillnaden mellan genmappning och gensekvensering

De huvudskillnad mellan gen kartläggning och gen sekvensering är att genkartläggning identifierar genens locus och deras relativa avstånd inom genomet, medan gen-sekvenseringen spelar ut nukleotidernas ordning, vilket utgör generna i genomet. Vidare resulterar genkartläggning i ett mindre detaljerat resultat medan genföljning resulterar i ett fullständigt detaljerat resultat. 

Genmapping och gensekvensering är två typer av genomanalysmetoder som hjälper till att erhålla olika typer av information om genomer. 

Viktiga områden som omfattas 

1. Vad är Gene Mapping
     - Definition, metod, betydelse
2. Vad är gensekvensering
     - Definition, metod, betydelse
3. Vad är likheterna mellan genmappning och gensekvensering
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan genmappning och gensekvensering
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp 

Genmappning, gensekvensering, lokalisering, nukleotidsekvens, fysisk kartläggning, relativ avstånd

Vad är Gene Mapping 

Genmappning är identifieringen av genen och deras relativa avstånd i genomet. Därför innehåller en genkarta en rad landmärken av korta DNA-sekvenser eller regleringsställen, som slår på och stänger av gener. Således är det en endimensionell karta, som är linjär. Generna eller de andra viktiga sekvenserna i en genkarta heter också med bokstäver och siffror; till exempel D14S72 och GATA-P7042. Vidare är mätenheten av avståndet mellan två gener centimorgan. En centimorgan är lika med andelen av två oberoende ärftliga gener. Det hjälper till att utforska ett visst genom och att navigera runt genomet. Det bidrar också till att identifiera nya gener i genomet.  

Figur 1: Genkarta i Drosophila

Gen kartläggning möjliggör för forskarna att identifiera de gener som är inblandade i sjukdomar. För detta kan de kartlägga genomerna hos de familjer som drabbats av en viss sjukdom. Här blir de andra landmärken som ligger nära de sjukdomsframkallande generna markörer för den specifika genen. Identifiering av sådana landmärken bidrar till att identifiera den exakta platsen för den sjukdomsframkallande genen i genomet. Därför kommer detta att begränsa storleken på DNA-stycket som ska undersökas utifrån hela genomet. Därefter kan forskarna testa den valda uppsättningen landmärken med samma landmärken från friska individer för att identifiera den exakta genen som är relaterad till sjukdomen. Således kan genkartläggning identifiera de gener som är ansvariga för sjukdomar såsom Huntingtons sjukdom, cystisk fibros, etc. 

Vad är gensekvensering 

Gen-sekvensering är en mer avancerad metod än genkartläggning. Det identifierar varje nukleotid i en viss del av DNA. Därför, eftersom det avslöjar upp till DNA-nukleotidnivån, kan genföljande ge mer detaljerad information om genomet. Går vidare in i metoderna för gensekvensering; den huvudsakliga metoden för gensekvensering är hagelgevärssekvenseringen. Här tillåter splittringen av genomet i små fragment att karakterisera varje fragment. Därefter sammanställs sekvenserna för varje fragment för att erhålla hela sekvensen av genomet.

Figur 2: Skillnad mellan genmappning och gensekvensering

Trots att gensekvensering är helt annan process, liknar den processen med fysisk kartläggning. Fysisk kartläggning och genkartläggning är de två typerna av genomkartläggning. Vid fysikalisk kartläggning ger genriktningsbegränsningen av genomet korta fragment, vilka sedan analyseras. Den ultimata fysiska kartan görs genom montering av alla restriktionsfragmenten tillsammans. Emellertid kan fysisk kartläggning inte ge ett detaljerat resultat som gensekvensering. 

Likheter mellan genmappning och gensekvensering 

• Genmappning och gensekvensering är två metoder för genomanalys. 
• De ger information om genernas placering. 
• Båda metoderna har också fördelar vid bestämningen av sjukdomsframkallande gener i genomet. 

Skillnad mellan genmappning och gensekvensering 

Definition 

Genmappning hänvisar till kartläggningen av generens positioner på en DNA-molekyl eller kromosom och avståndet i bindningsenheter eller fysiska enheter mellan gener medan gensekvensering avser förfarandet för att bestämma sekvensen av nukleotider i ett segment av DNA. Således förklarar detta huvudskillnaden mellan genkartläggning och genföljning.

Betydelse 

En annan skillnad mellan genkartläggning och gensekvensering är att genkartläggningen identifierar genomkännetecken för genomet medan gensekvensering stavar sekvensen av nukleotider i genomet. 

Detailedness 

Resultatet av genkartläggningen ger också mindre detaljer medan resultatet av gensekvenseringen är fullständigt detaljerad. Detta är också en stor skillnad mellan genkartläggning och genföljning.

Tid och kostnad 

Genkartläggningen är emellertid en billig metod, vilket är mindre tidskrävande medan gensekvensering är en dyr metod som tar tid.  

Slutsats 

Genmappning är en metod för identifiering av landmärken såsom gener och deras regulatoriska sekvenser i genomet. Att vara specifik ger den exakta platsen för dessa landmärken i genomet och deras relativa avstånd. Å andra sidan är gen sekventering en avancerad metod för genomanalys, vilket stavar ut alla nukleotider av genomet och deras ordningsföljd. Därför är huvudskillnaden mellan genkartläggning och gensekvensering detaljering av den information de tillhandahåller. 

Referens:

1. "GENOME MAP." GNN - Genome News Network, J. Craig Venter Institute, 15 jan 2003, tillgänglig här

Image Courtesy:

1. "Drosophila Gene Linkage Map" Av Twaanders17 - Egent arbete (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia  
2. "NHGRI Fact Sheet-Genetic Mapping (27058469495)" Av National Human Genome Research Institute (NHGRI) från Bethesda, MD, USA - NHGRI Faktablad: Genetic Mapping (CC BY 2.0) via Wikimedia Commons