Vad är skillnaden mellan gensekvensering och DNA fingeravtryck

De huvudskillnad mellan gen sekvensering och DNA fingeravtryck är att gensekvensering är involverad i identifieringen av nukleotidsekvensen hos en gen medan DNA-fingeravtryckningen är involverad i identifieringen av små variationer i DNA hos en viss individ. Gensekvensering är dessutom en metod som hjälper till att få information om gener medan DNA-fingeravtryck är en metod som hjälper identifieringen av individer.

Gen-sekvensering och DNA-fingeravtryck är två tekniker inom bioteknik som hjälper till att erhålla information från genomer.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är gensekvensering
     - Definition, metod, betydelse
2. Vad är DNA fingeravtryck
     - Definition, metod, betydelse
3. Vad är likheterna mellan gensekvensering och DNA-fingeravtryck
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan gensekvensering och DNA fingeravtryck
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp

DNA-fingeravtryckning, gensekvensering, mikrosatellit-DNA, nukleotidsekvens, STRs

Vad är gensekvensering

Gen-sekventering är en metod som vi använder för att identifiera nukleotidsekvensen hos en gen. På grund av förmågan hos gensekvensering att avslöja informationen från en gen upp till nukleotidnivån, bidrar den till att erhålla den mest detaljerade informationen om genen. Därför kan detta bidra till att identifiera olika sekvenselement i en gen, inklusive den öppna läsramen liksom de regulatoriska sekvenserna, såsom promotorn. Vidare är de två metoder som är involverade i gensekvensering sanger-sekvensering och nästa generationssekvensering.

Figur 1: Gensekvensering

Informationen som erhållits från gensekvensering är viktig för identifieringen av mutationer inom gensekvensen, som i sin tur avslöjar de sjuka generna. Det identifierar också nya former av gener som heter allelerna.

Vad är DNA fingeravtryck

DNA-fingeravtryck är en metod som vi använder vid identifieringen av de korta DNA-sekvenserna som är specifika för en viss individ. Dessa korta DNA-sekvenser är de upprepande elementen som kallas korta tandemrepetitioner (STRs), som huvudsakligen finns i de kromosomens centromeriska områden. Här är STR: erna en typ av icke-kodande DNA som kategoriseras under mikrosatelliter. Deras upprepande enhet består av 2-6 nukleotider. Även antalet upprepningar i genomet beror på individen. På det sättet kan man, genom att jämföra antalet upprepningar på ett visst ställe, identifiera enskilda personer. Därför är DNA-fingeravtryck viktigt vid identifieringen av individer. Vidare är huvudanvändningen av DNA-fingeravtryck i rättsmedicinska studier.

Figur 2: STR-variation mellan enskilda personer

DNA-fingeravtryck är inblandad i digestionen av satellit-DNA hos DNA-provet av intresse med restriktionsenzymer. Sedan kan fragmenten separeras genom agarosgelelektrofores. Slutligen jämförs bandmönstret med de misstänkta proverna.

Likheter mellan gensekvensering och DNA-fingeravtryck

• Gen-sekvensering och DNA-fingeravtryck är två typer av tekniker som hjälper till att erhålla information om genomer.
• Båda teknikerna har ett brett utbud av applikationer.

Skillnad mellan gensekvensering och DNA fingeravtryck

Definition

Gen-sekvensering hänför sig till processen för att fastställa sekvensen av nukleotider i ett segment av DNA medan DNA-fingeravtryck hänför sig till analysen av DNA från prover av kroppsvävnader eller vätskor, speciellt när de genomförs för att identifiera individer. Därför är detta grunden till skillnaden mellan gensekvensering och DNA-fingeravtryck.

Typ av metoder 

Gen-sekvensering involverar Sanger-sekvensering eller nästa generationssekvensering medan DNA-fingeravtryckning innefattar restriktionsmältning och gelelektrofores.

Typ av information Erhållen

En annan skillnad mellan gensekvensering och DNA-fingeravtryck är att gen-sekvensering avslöjar nukleotidsekvensen hos en gen medan DNA-fingeravtryck avslöjar mönstret för STRs av ett visst lokus hos en individ.

Betydelse

Gen-sekvensering identifierar nya alleler och sjuka gener medan DNA-fingeravtryck identifierar individer. Detta är också en viktig skillnad mellan gensekvensering och DNA-fingeravtryck.

Slutsats

Gen-sekventering är en metod som identifierar nukleotidsekvensen hos en gen. Det hjälper till att identifiera sjuka gener eller nya former av gener som kallas allelerna. Å andra sidan är DNA-fingeravtryck en metod vi använder för att erhålla mönstret av STR på ett visst ställe i genomet. Eftersom STR-mönstret är unikt för en viss individ hjälper det till identifiering av individer. Därför är den huvudsakliga skillnaden mellan gensekvensering och DNA-fingeravtryck vilken typ av information de hjälper till att erhålla och deras betydelse.

Referens:

1. "DNA-sekvensering". Khan-akademin, Khan-akademin, tillgänglig här
2. "Vad är ett DNA-fingeravtryck?" Din genom, det offentliga engagemangsteamet på Wellcome Genome Campus, 2 juni 2016, tillgängligt här

Image Courtesy:

1. "Radioactive Fluorescent Seq" Av Abizar på engelska Wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia  
2. "D1S80Demo" Av PaleWhaleGail på engelska Wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia