Vad är skillnaden mellan förstärkare och promotor

De huvudskillnad mellan förstärkare och promotor är det förstärkaren är DNA-sekvensen till vilken aktivatorerna binder, medan promotorn är DNA-sekvensen till vilken RNA-polymeras och andra basala transkriptionsfaktorer binder. Vidare är förstärkaren ansvarig för att öka graden av transkription medan promotorn är ansvarig för initiering av transkription.

Förstärkare och promotor är de två korta DNA-sekvenserna som tjänar som regulatoriska element i en gen. Deras huvudsakliga funktion är att reglera transkription.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är Enhancer
     - Definition, Funktioner, Funktion
2. Vad är Promoter
     - Definition, Funktioner, Funktion
3. Vad är likheterna mellan förstärkare och promotor
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan förstärkare och promotor
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp

Enhancer, promotor, transkriptionshastighet, RNA-polymeras, transkriptionsfaktorer, transkriptionsinitiering

Vad är Enhancer

En förstärkare är ett cis-verkande element som är involverat i att öka aktiviteten hos en speciell promotor. Det är en kort DNA-sekvens av cirka 50-1500 bp och transkriptionsfaktorerna som kallas aktivatorer kan binda till den. Platsen för förstärkaren kan vara upp till 1 Mbp bort från promotorn. Det kan också vara uppströms eller nedströms till promotorn. Genom placeringen ligger långt ifrån promotorn är förstärkarna rumligt nära promotorn, vilket möjliggör interaktionen med RNA-polymeras och basala transkriptionsfaktorer. Aktivatorerna bundna till förstärkningsområdet bind sedan med ett mediatorkomplex, vilket i sin tur rekryterar RNA-polymeraset och de basala transkriptionsfaktorerna till promotorstället. Orienteringen av förstärkarsekvensen har ingen inverkan på denna åtgärd.

Figur 1: Enhancer

Förstärkarens antagonister är ljuddämparna, vilka kan binda till transkriptionsfaktorerna som kallas förtryckare. Suppressorer kan nedreglera graden av transkription.

Vad är Promoter

Promoter är ett av huvudregleringarna i genen som initierar transkriptionen. Det ligger nära genen, uppströms kodonsekvensen. Storleken på promotorn kan vara 100-1000 bp. De specifika DNA-sekvenserna som kallas responselement tillhandahåller initialbindningsställen för både RNA-polymeras och transkriptionsfaktorer som rekryterar RNA-polymeras. RNA-polymeras är enzymet som är ansvarigt för transkriptionen, polymeriserande komplementära RNA-nukleotider för att syntetisera en mRNA-molekyl.

Figur 2: Promoter

Bakteriellt RNA-polymeras associerat med sigmafaktor kan binda till promotorn. Sigma-faktorn är en bakteriell transkriptionsinitieringsfaktor. I eukaryoter måste omkring 7 olika basala transkriptionsfaktorer vara bundna till promotorn för att rekrytera RNA-polymeras.

Likheter mellan Enhancer och Promoter

• Enhancer och promotor är två korta DNA-sekvenser som kan uppträda uppströms genens kodonsekvens.
• De förekommer i både eukaryoter och prokaryoter.
• Olika typer av transkriptionsfaktorer binder också till båda DNA-sekvenserna.
• Vidare är huvudfunktionen hos de två DNA-sekvenserna att reglera transkription.

Skillnad mellan Enhancer och Promoter

Definition

Enhancer hänför sig till DNA-sekvensen som ökar graden av transkription av en gen medan promotorn refererar till DNA-sekvensen som initierar transkription av en speciell gen.

Plats

En viktig skillnad mellan förstärkaren och promotorn är att en förstärkare kan vara belägen uppströms eller nedströms mot genen medan en promotor uppträder uppströms genen i samma kromosom.

Bind till

Vidare binder transkriptionsaktivatorer till förstärkaren medan RNA-polymeras och basala transkriptionsfaktorer binder till promotorn. Detta är en stor skillnad mellan förstärkaren och promotorn.

Roll

En annan skillnad mellan förstärkaren och promotorn är att förstärkarna är involverade i att öka graden av transkription medan promotorer är involverade i att kontrollera transkriptionsstart.

Orientering

Dessutom är funktionen hos förstärkaren inte beroende av orienteringen, medan promotorns funktion helt beror på orienteringen.

Slutsats

En förstärkare är ett cis-regulatoriskt element till vilket aktivatorer binder för att öka graden av transkription. Det kan lokaliseras på kort eller långt avstånd till genen kontrollerad av förstärkaren. Å andra sidan är en promotor DNA-sekvensen till vilken RNA-polymeras binder tillsammans med de basala transkriptionsfaktorerna. Det ligger nära genen reglerad av promotorn. Huvudskillnaden mellan förstärkaren och promotorn är rollen och platsen med avseende på genen.

Referens:

1. "Enhancer (Genetics)." Enhancer-Genetics, ScienceDirect, tillgängligt här
2. "Promoters." Addgene, tillgängligt här

Image Courtesy:

1. "Figur 16 04 01" Av CNX OpenStax - (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia  
2. "Reportergen" (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia