Skillnad mellan YAC och BAC vektorer

De huvudskillnad mellan YAC och BAC vektorer är att YAC-vektorer (jäst-artificiella kromosomvektorer) innehåller molekylkomponenterna för replikation inuti jäst medan BAC-vektorerna (bakteriella artificiella kromosomvektorer) innehåller molekylära komponenter för replikering inuti bakterier. Vidare är storleken på insatsen som bärs av YAC-vektorer 100-1000 kb medan storleken på insatsen som bärs av BAC-vektorer är 100-200 kb.

YAC- och BAC-vektorer är två typer av artificiella vektorsystem konstruerade för att klona stora genomiska DNA-fragment. De har flera applikationer vid framställning av genomiska och cDNA-bibliotek.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är YAC vektorer
- Definition, Funktioner, Konstruktion
2. Vad är BAC-vektorer
- Definition, funktioner, applikationer
3. Vad är likheterna mellan YAC och BAC vektorer
- Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan YAC och BAC vektorer
- Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp

BAC-vektorer, kloningskapacitet, värd, vektorkomponenter, YAC-vektorer

Vad är YAC vektorer

YAC (Gjäst artificiell kromosom) -vektorer är en typ av artificiella kromosomer avsedda att transformera till jästceller efter kloning av stora DNA-fragment. Den består av elementen i en typisk jästkromosom. Dom är;

CEN - En jästcentromer, som säkerställer segregeringen i två dotterceller under reproduktion.
ARS - Reproduktionsstart för den autonoma replikationen inuti jästcellen
TEL-Tomer-regionen
TRP1 och URA3 - Selekterbara markörgener för valet av transformerade jästceller
Bakteriell selekterbar markörgen
BamHI- och EcoRI-restriktionsställen - För linjärisering och införande av DNA-fragmentet

Konstruktion av YAC vektorer

Linearisering av en cirkulär DNA-plasmid genom restriktionsmältning med BamHI
Restriktionsmältning med EcoRI
Ligering med DNA-fragmentet av intresse
Figur 1: Konstruktion av YAC Vector

Några exempel på YAC-vektorer är YAC72 och YAC46. Storleken på DNA-fragmentet som kan införas i en YAC-vektor är 100-1000 kb.

Vad är BAC-vektorer

BAC (Bakteriell artificiell kromosom) -vektorer är en typ av artificiella kromosomer avsedda att transformera till bakterier, speciellt E. coli, efter kloning av stora DNA-fragment. Storleken på DNA-fragmentet som kan sättas in i en BAC-vektor är 100-200 kb. Strukturen för BAC-vektorn är baserad på fertilitetsplasmiden / F-plasmiden. De gemensamma komponenterna i en BAC-vektor är;

repE - Medierar sammansättningen av replikationskomplexet
parA och parB - För partitionering av gener under replikering
Valbar markör - För val av transformanter; kan vara en antibiotikaresistensgen eller LacZ
T7 och SP6 - Främja transkriptionen av skäret
OriS - För ensidigt ursprung för replikering
Figur 2: Konstruktion av BAC Vector

BAC-vektorer användes ofta i sekvensering under Human Genome Project. BAC-vektorer används vid modellering av genetiska sjukdomar, såsom Downs syndrom och neurologiska sjukdomar, såsom Alzheimers sjukdom. Även klonerna hos några stora DNA- och RNA-virus klonas i BAC-vektorer. PAC är en liknande vektor till BAC, som produceras baserat på P1 bakteriofagen.

Likheter mellan YAC och BAC vektorer

YAC- och BAC-vektorer är artificiella vektorsystem konstruerade för insättning av stora DNA-fragment.
Båda kommer som cirkulära plasmider.
De har flera applikationer vid framställning av genomiska och cDNA-bibliotek.

Skillnad mellan YAC och BAC vektorer

Definition

YAC-vektorerna hänför sig till en vektor (bärare) konstruerad från de telomeriska, centromera och replikations-ursprungssekvenserna som behövs för replikation i jästceller medan BAC-vektorerna hänför sig till en DNA-konstruktion baserad på en funktionell fertilitetsplasmid (eller F-plasmid) som användes för transformering och kloning i bakterier, vanligtvis E. coli.

Värd

YAC-vektorer transformeras till jästceller medan BAC-vektorer transformeras till bakterier.

Baserat på

YAC-vektorn framställs baserat på de specifika regionerna i jästkromosomen medan BAC-vektorerna produceras baserat på F-plasmiden.

Konfiguration

YAC-vektorer är linjära medan BAC-vektorer är cirkulära.

Kopia nummer

En enda YAC-vektor uppträder per jästcell medan 1-2 BAC-vektorer uppträder per bakteriecell.

Kloningskapacitet

YAC-vektorer har en hög kloningskapacitet, eftersom dess insats kan vara upp till 1000 kb, medan BAC-vektorer har mindre kloningskapacitet, eftersom dess insats kan vara upp till 200 kb i storlek.

Slutsats

YAC-vektorn är ett konstgjort vektorsystem med hög kloningskapacitet (upp till 1000 kb) medan BAC-vektorn är ett artificiellt vektorsystem med låg kloningskapacitet (upp till 200 kb) jämfört med YAC. YAC-vektorer transformeras till jästceller medan BAC-vektorer transformeras till bakterier. Huvudskillnaden mellan YAC- och BAC-vektorer är deras kloningskapacitet och värd.

Referens:

1. Monaco, Anthony P och Zoia Larin. "YAC, BAC, PAC och MAC: Konstgjorda kromosomer som forskningsverktyg". Trender inom bioteknik, Elsevier, 26 Aug. 2004, Tillgänglig Här

Image Courtesy:

1. "Konstruktion av en YAC chem114A" Av Tinastella på engelska Wikibooks - Överförd från en.wikibooks till Commons. (Public Domain) tillgängligt här
2. "BACs-kloningsvektorer Chem114A" Av Tinastella (CC BY-SA 3.0) via Wikimedia Commons

Vetenskap