Skillnad mellan YAC och M13 Phage Vector

Huvudskillnad - YAC vs M13 Fagvektor
 

DNA-kloning är en viktig process som möjliggör förökning av viktiga DNA-fragment av organismer. Det kräver sammanfogning av specifikt DNA med vektor-DNA för att skapa rekombinant DNA som transformerar till värdorganismen. En vektor är en DNA-molekyl som uppträder som ett vehikel för att bära främmande genetiskt material i en annan cell eller organism. Den ska kunna replikera inuti värdorganismen och producera flera kopior av rekombinant DNA. Det finns olika typer av vektorer som används vid DNA-kloning. Jäst artificiell kromosom (YAC) och M13 fagvektor är två typer bland dem. Nyckelfaktorn mellan YAC och M13 fagvektorn är det YAC är en artificiell kromosom som replikerar i jästceller medan M13-fagvektorn är en enkelsträngad cirkulär DNA av bakteriofag M13 som replikerar i E coli celler.

INNEHÅLL
1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är YAC
3. Vad är M13 Phage Vector
4. Jämförelse vid sida vid sida - YAC vs M13 Phage Vector
5. Sammanfattning

Vad är en YAC-vektor?

YAC är en artificiellt byggd kromosom som har förmågan att bära ett stort segment av främmande DNA och replikera i jästcellerna. Det har centromerer, telomer och autonomt replikerande sekvenser som är nödvändiga för replikation och stabilitet. YAC bör också bära en selektiv markör eller markörer och restriktionsställen för att göra den till en effektiv kloningsvektor. Stora sekvenser som sträcker sig från 1000 kb till 2000 kb kan sättas in i YAC och överföras till jäst.

Figur 01: YAC Vector

Vad är M13 Phage Vector?

Bakteriofag M13 är ett virus som infekterar och replikerar i E coli. Genomet av M13 bakteriofagen är liten i storlek, ca 6,7 ​​kb. Det är en enkelsträngad, cirkulär och positiv sans DNA. Detta virus infekterar specifikt E coli bakterier genom F pilus. När det väl har kommit in i ssDNA i bakterien, syntetiserar den dess komplementära sträng och blir dsDNA eller den replikativa formen (RF) av M13. RF kan uppträda som en plasmid i värdorganismen. DsDNA replikerar inom E coli och producerar ssDNA som bär nya fager. Dessa nya fager frigörs kontinuerligt från E coli utan att döda värdcellen. Infektionen minskar emellertid tillväxten av E Coli. dsDNA kan extraheras från bakterieceller och användas som vektorer vid DNA-kloning. De är kända som M13-fagvektorer. De kan enkelt manipuleras och användas på liknande sätt som plasmidvektorer.

Den inneboende infektionsförmågan hos dessa M13-fager tjänar som en god kvalifikation för att användas som en vektor vid genkloning. När man utvecklar M13 till en vektor, bör flera element inkorporeras i dess genom. De är en gen för lac repressor (lac I) protein, den operatör-proximala regionen av lac Z gen, en lac-promotor och en multipel kloningsplats (polylinker). När dsDNA från M13 används som vektorer kan den behandlas som en plasmidvektor. Användningen av ssDNA M13 har emellertid fördelar i DNA-sekvensering och ställdriktad mutagenes.

Eftersom M13 fagvektor bär flera kloningsställen i lacZ region, kan rekombinerade vektorer lätt identifieras genom blå / vit koloninscreening på agarplattor innehållande IPTG och X-Gal. Blåplåtar som produceras på plattorna innehåller inte de rekombinerade fagerna. Därför kan fag med insatser väljas för kloningsändamålet.

Figur 02: Bakteriofag M13

Vad är skillnaden mellan YAC och M13 Phage Vector?

YAC vs M13 Fagvektor
YAC är en genetiskt konstruerad kromosom som har förmågan att bära ett stort segment av främmande DNA och replikera i jästcellerna.	M13-fagvektor är en viral vektor som utvecklats av bakteriofag M13 som används för att införa främmande DNA i E coli.
Ändamål
YACs utformades för att klona stora fragment av genomiskt DNA i jäst.	M13-fagvektorer används för att införa främmande DNA E coli.
Infoga längd
YAC kan innehålla megabasstorlek genomiska insatser (1000 kb - 2000 kb).	Inläggets storlek är cirka 1 500 bps.
Konstruktion
YAC-DNA är svårt att rena intakt och kräver en hög koncentration för att generera YAC-vektorsystem.	Det sker via cyklisk fotosyntetisk elektronkedja.
Stabilitet
YAC är instabil.	M13 fager kan enkelt extraheras.
Storlek
Enzymer är större molekyler.	M13 fager är stabila än YAC.

Sammanfattning - YAC vs M13 Fagvektor

YAC är ett konstgjort konstruerat vektorsystem med användning av en specifik region av jästkromosom för att införa stora segment av genetiskt material till jästceller. M13-fagvektor är ett vektorsystem härlett från bakteriofag M13 som använder E coli som värdorganismen. Detta är den största skillnaden mellan YAC och M13 Phage Vector. Båda är lika användbara i rekombinant DNA-teknik och genkloning.

Referens:
1. "Vektor". Genetik-anteckningar - vektor. N.p., n.d. Webb. 16 maj 2017. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Yeast artificial chromosome." Wikipedia. Wikimedia Foundation, 21 april 2017. Web. 16 maj 2017. .

Image Courtesy:
1. "M13B" Av J3D3 - Egent arbete (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia