Skillnad mellan repetitivt DNA och satellit DNA

Huvudskillnad - Repetitivt DNA vs Satellit DNA

Repetitivt DNA och satellit DNA är två typer av DNA som finns i genomet av de flesta eukaryoter. De huvudskillnad mellan repetitivt DNA och satellit-DNA är det repetitivt DNA är små sekvenser av DNA som upprepas hundratals eller tusentals gånger medan satellit-DNA är höggradigt repetitiva DNA-sekvenser, som utgör en betydande del av genomet. De två typerna av upprepningar som finns i genomet är tandemupprepningar och upprepade upprepningar. Satellit DNA består av många tandem upprepningar av en kort grundläggande upprepande enhet. Den ligger på specifika kromosomer av det humana genomet och i närheten av kromosomernas centromerer.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är repetitivt DNA
     - Definition, Fetter, Typer
2. Vad är Satellite DNA
     - Definition, Fakta, Typer
3. Vad är likheterna mellan repetitivt DNA och satellit-DNA
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan repetitivt DNA och satellit DNA
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelord: Interspersed Repeats, Microsatellites, Minisatellites, Repetitive DNA, Satellite DNA, Tandem Repeats

Vad är repetitivt DNA

Repetitivt DNA refererar till sträckorna av DNA som upprepas genom genomet. Det representerar en viss mängd av den icke-kodande DNA-spridningen genom eukromatinet. Den repetitiva enheten kan bestå av få baspar till hundratals baspar. Den genomsnittliga storleken på den repetitiva enheten är 300 bp. Det kan upprepas för 10-10⁵ kopior per genom. De två huvudtyperna av repetitivt DNA är tandemupprepningar och upprepade upprepningar. Tandem upprepningar visas i Figur 1.

Figur 1: Tandem Repeats

Vid tandemrepetitioner ligger kopiorna av en repetitiv sekvensenhet intill varandra, bildande ett block eller en grupp. Satellit DNA är en typ av tandem upprepningar. I upprepade upprepningar dispergeras de repetitiva sekvenserna genom genomet som enskilda enheter flankerade av unik sekvens. De transposerbara elementen såsom DNA-transposoner och retrotransposoner är upprepade upprepningar.

Vad är Satellite DNA

Satellit DNA hänför sig till korta, repetitiva DNA-sekvenser som ofta finns i centromerala regioner av genomet. Det är de viktigaste funktionella enheterna i centromeren. Satellit DNA finns också i heterochromatin som en viktig strukturell beståndsdel. I det mänskliga genomet kan satellit DNA hittas i kromosomerna 1, 9 och 16 och de korta armarna av kromosomerna 13-15, 21 och 22. Satellit DNA är en typ av tandemrecept. Den består av korta nukleotidsekvenser runt 60 bp som upprepas mer än 10⁶ gånger i genomet. De två huvudtyperna av satellit-DNA är minisatelliter och mikrosatelliter. En minisatellitsekvens visas i figur 2.

Figur 2: Minisatellit DNA

Minisatelliter består av 10-60 baspar i den upprepande enheten. De ligger på många ställen i genomet, inklusive centromerer. Mikrosatelliter består av mindre än 10 baspar i den upprepande enheten, och de finns huvudsakligen i telomererna.

Likheter mellan repetitivt DNA och satellit DNA

• Repetitivt DNA och satellit-DNA är två typer av DNA som finns i det eukaryota genomet.
• Både repetitivt DNA och satellit-DNA består av upprepande sekvensenheter.
• Både repetitivt DNA och satellit-DNA är typer av icke-kodande DNA.
• Både repetitivt DNA och satellit-DNA kodar inte för proteiner.
• Både repetitivt DNA och satellit-DNA är belägna i intergena regioner.
• Både repetitivt DNA och satellit-DNA är viktiga för att upprätthålla genomets struktur.

Skillnad mellan repetitivt DNA och satellit DNA

Definition

Repetitivt DNA: Repetitivt DNA refererar till sträckorna av DNA som upprepas genom genomet.

Satellit DNA: Satellit-DNA hänför sig till de korta repetitiva DNA-sekvenserna, som ofta finns i centromerala regioner av genomet.

Typer av repetitiva sekvenser

Repetitivt DNA: Repetitivt DNA består av antingen tandemupprepningar eller upprepade upprepningar.

Satellit DNA: Satellit DNA består av tandem upprepningar.

Den repeterande enhetens storlek

Repetitivt DNA: Repetitivt DNA kan bestå av få baspar till hundratals baspar i den repetitiva enheten.

Satellit DNA: Satellit DNA består av korta upprepande enheter (upp till 60 baspar långa). 

Repetitionsgrad

Repetitivt DNA: Repetitivt DNA är måttligt repetitiva sekvenser (10-10⁵ upprepningar per genom).

Satellit DNA: Satellit DNA består av mycket repetitiva sekvenser (> 10⁶ upprepningar per genom).

Ligger i

Repetitivt DNA: Repetitivt DNA ligger i genets intergena regioner.

Satellit DNA: Satellit DNA ligger på specifika kromosomer och centromerer av kromosomerna.

typer

Repetitivt DNA: De två huvudtyperna av repetitivt DNA är tandemupprepningar och upprepade upprepningar.

Satellit DNA: De två huvudtyperna av satellit-DNA är mikrosatelliter och minisatelliter.

Roll

Repetitivt DNA: Repetitivt DNA tjänar som en evolutionär anordning, som katalyserar bildandet av nya gener.

Satellit DNA: Satellit DNA har en viktig roll i DNA-fingeravtryck.

I CsCl Density Gradient Analysis

Repetitivt DNA: Repetitivt DNA framträder som ljusband.

Satellit DNA: Satellit DNA visas som små mörka band.

Slutsats

Repetitivt DNA och Satellit DNA är två typer av DNA-repeter som finns i genomet. Repetitivt DNA är måttligt upprepade DNA-sekvenser medan satellit-DNA är högupprepade, korta DNA-sekvenser. Huvudskillnaden mellan repetitivt och satellit-DNA är graden av upprepning.

Referens:

1.López-Flores, I. och M.A. Garrido-Ramos. "Det återkommande DNA-innehållet i eukaryota genom." Karger Publishers, 25 juni 2012, Tillgänglig här.
2.Garrido-Ramos, Manuel A. "Satellit DNA: En utvecklande ämne." Genes, MDPI, september 2017, Tillgänglig här.

Image Courtesy:

1. "VNTR2individuals5or7repeats" Av Madelyndotson - Egent arbete (CC BY-SA 4.0) via Wikimedia Commons