Skillnad mellan CRISPR och Cas9

De huvudskillnad mellan CRISPR och Cas9 är det CRISPR är en del av en bakterie försvar system som består av korta palindromiska sekvenser medan Cas9 är ett endonukleas producerat av CRISPR-systemet som fungerar som molekylära saxar. CRISPR står för klyvda regelbundna interspaced korta palindroma upprepningar medan Cas står för CRISPR-associerat protein 9. De korta palindroma upprepningarna producerar CRISPR RNA (crRNA) som är specifik för målsekvensen. Cas9 skär DNA-sekvensen specificerad av crRNA. 

CRISPR och Cas9 är två komponenter i CRISPR / Cas9-systemet, en viktig del av bakteriens immunförsvar, som skyddar mot invaderande virus. För närvarande är CRISPR / Cas9-systemet ett av de snabbare, billigare och mer exakta genomredigeringsverktygen med ett brett utbud av applikationer. 

Viktiga områden som omfattas 

1. Vad är CRISPR
     - Definition, struktur, genom redigering
2. Vad är Cas9
     - Definition, Fakta, Genomredigering
3. Vad är likheterna mellan CRISPR och Cas9
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan CRISPR och Cas9
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp

Cas9, CRISPR, CRISPR / Cas9, crRNA, genomreaktion 

Vad är CRISPR 

CRISPR (Clustered Regularly jagnterspaced Short Palindromic Repeats) är en enhet av den upprepande sekvensen som finns i bakteriella och archaeala genomer. Det upptäcktes först i archaea av Francisco Mojica. De upprepande sekvenserna av CRISPR avbryts av distanssekvenser. Dessa distanssekvenser är rester från tidigare inkräktare. Därför tjänar systemet som det genetiska minnet för att detektera och förstöra den invaderande bakteriofagen. Distanssekvenserna transkriberas till korta RNA-sekvenser som kallas crRNA, vilka styr systemet för att binda till de specifika målsekvenserna. En gång bunden till en sådan sekvens skär ett endonukleas kodat av CRISPR-systemet som Cas9 det specificerade DNA genom att stänga av det.

Figur 1: CRISPR System

CRISPER / Cas9 är ett naturligt förekommande genomredigeringssystem i bakterier. Det används också som ett genomredigeringsverktyg i laboratoriet. Forskare skapar artificiellt små RNA-molekyler som kallas vägleda RNA (gRNA) som binder till en målsekvens av ett genom. När mål-DNA-sekvensen sönderdelas av aktiviteten hos Cas9, syntetiserar cellulära mekanismer DNA. Annars kan den borttagna delen av DNA ersättas med en annan DNA-bit.  

Vad är Cas9 

Cas9 är ett endonukleas som skär specifikt dubbelsträngat DNA. Den kodas av det bakteriella CRISPR-systemet. Mål-DNA-sekvensen specificeras av sycrRNA i CRISPR-systemet. Genom att manipulera målsekvensen kan CRISPR-systemet användas för att manipulera en speciell DNA-sekvens i ett genom. Därför används CRISPR / Cas9-systemet för att behandla genetiska störningar.

Figur 2: Casens roll i CRISPR-systemet

En annan typ av endonukleaser som kan fungera med CRISPR-systemet är Cpf1.  

Likheter mellan CRISPR och Cas9  

• CRISPR och Cas9 är två komponenter i CRISPR / Cas9-systemet. 
• Båda spelar en vital roll i det adaptiva immunsystemet hos bakterier genom att identifiera och fragmentera viralt DNA från bakteriegenomet. 
• CRISPR / Cas9-systemet används som ett genomredigeringsverktyg. 

Skillnad mellan CRISPR och Cas9  

Definition 

CRISPR hänför sig till en familj av DNA-sekvenser som finns i bakterier och archaea medan Cas9 avser ett RNA-styrt DNA-endonukleas associerat med CRISPR

Står för 

CRISPR står ihop med regelbundna interspaced korta palindroma upprepningar medan Cas står för CRISPR-associerat protein. 

Betydelse 

CRISPR är ett kluster av korta palindroma sekvenser medan Cas9 är en endonukleas kodad inom CRISPR. 

Fungera 

CRISPR producerar crRNA som specifikt binder till en målsekvens medan Cas9 tjänar som en molekylär sax som skär DNA-sekvensen specificerad av crRNA. 

Slutsats 

CRISPR är ett kluster av korta palindroma sekvenser som finns i bakteriegenomet. Det är viktigt att förebygga den invaderande bakteriofagen. Cas9 är ett endonukleas kodat av CRISPR-systemet. Det skär av nukleotidsekvensen specificerad av crRNA. CrRNA produceras genom transkription av CRISPR-matrisen. Huvudskillnaden mellan CRISPR och Cas9 är funktionen för varje komponent i CRISPR-systemet. 

Referens:

1. "Vad är CRISPR-Cas9?" Fakta, Public Engagement Team på Wellcome Genome Campus, 19 dec 2016, tillgängligt här

Image Courtesy:

1. "crRNA-Cas9" Av marius walter - Egent arbete (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. "Crispr" Av James atmos - eget arbete (CC BY-SA 3.0) via Wikimedia Commons