Skillnad mellan Gene Knockout och Knockdown

De nyckelskillnad mellan genknockout och knockdown är att genknockout är en teknik där genen av intresse är helt avlägsnad (inoperativt tillstånd) att studera genens funktioner medan genknockdown är en annan teknik där genen av intresse är tystnad att undersöka den specifika genens roll i ett biologiskt system.

Olika genetiska tekniker är i drift för att undersöka genernas funktion inom de levande biologiska systemen. Gene knockout och knockdown är två sådana tekniker. Dessa tekniker hjälper forskare att identifiera funktionella aspekter av olika gener i levande organismer.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är Gene Knockout
3. Vad är Gene Knockdown
4. Likheter mellan Gene Knockout och Knockdown
5. Sid vid sida Jämförelse - Gene Knockout vs Knockdown i tabellform
6. Sammanfattning

Vad är Gene Knockout?

Gene knockout är en genetisk teknik som gör att en eller flera gener inte fungerar i levande organismer. Detta är också en process att stänga av eller radera en gen av en organism. Den primära tillämpningen av denna teknik är att studera genfunktionen. Processen utvärderar effekten av den förlorade eller borttagna genen. Knockout-processen inbegriper också vissa enzymer och splicingstekniker.

Figur 01: Gene Knockout

Det finns få variationer i genknockout-tekniken baserat på antalet gener som är involverade. Dom är dubbel knockout (knockout av två gener), trippel knockout (knockout av tre gener) och fyrdubbla knockout (knockout av fyra gener). Gene knockout klassificeras vidare i två grupper; heterozygot knockouts och homozygot knockouts.

Vad är Gene Knockdown?

Gene knockdown är ett experimentellt förfarande där detta förfarande undertrycker eller minskar uttrycket av en viss gen eller gener av en organism. Genavstängning är den gemensamma definitionen för genknockdown. Under denna procedur involverar aktiveringen eller nedbrytningen av det producerade mRNA RNA-interferens (RNAi), små interfererande RNA (siRNA) och kort hårnål-RNA (shRNA).

Figur 02: Gensläckning

Den primära användningen av genknockdown är att undersöka den specifika genens roll i det biologiska systemet. Därför fullbordar denna teknik studien av onkogener (Bcl-2 och P53) och gener som orsakar neurologiska sjukdomar, virusinfektioner och ärftliga sjukdomar.

Vad är likheterna mellan Gene Knockout och Knockdown?

• Både genknockout och genknockdown är genetiska tekniker.
• Dessa två tekniker kan förhindra genuttryck.
• Den primära användningen av båda teknikerna är att undersöka funktionen av genen av intresse.
• Båda kan identifiera olika sjukdomstillstånd (genetiska).
• De båda kunde användas för en eller flera gener av intresse.

Vad är skillnaden mellan Gene Knockout och Knockdown?

Gene Knockout vs Knockdown
Gene knockout är i drift av gener (avlägsnande av gener från DNA) hos en organism genom olika genetiska tekniker.	Gene knockdown är ett experimentellt förfarande för att undertrycka (reducera eller tysta) uttrycket av en speciell gen eller gener av en organism.
Fungera
Underlättar studien av generens funktioner genom att analysera resultaten av den förlorade genen.	Underlättar studien av onkogener, gener som orsakar neurologiska sjukdomar, virusinfektioner och ärftliga sjukdomar.
Inblandning av RNA-agenter
Inblandning av RNA-medel är obetydlig i denna teknik.	Processen involverar agenterna såsom siRNA, shRNA och RNAi för att inaktivera mRNA.
Användning av kemiska medel
Enzymatiska medel används.	Inga sådana kemiska medel används.
Effekt på gen
Helt avlägsnar genen från DNA: n.	Undertrycka eller tysta genen.
Klassificering
Double knockout, triple knockout och quadruple knockout och heterozygous och homozygous knockout är olika typer av genknockout.	Inga sådana klassificeringssystem tillgängliga för genavstängning.

Sammanfattning - Gene Knockout vs Gene Knockdown

De två teknikerna vi diskuterade här genen knockout och knockdown, är metoder för att undersöka funktionerna av olika gener. Gene knockout gör genen fullständigt inoperativ medan genknockdown tystnar genen av intresse. Båda förfarandena hindrar emellertid genuttrycket. Olika agenter är kapabla att åstadkomma dessa två processer. Gene knock out är en typ av radering medan genknockdown är en typ av inaktivering. Detta är skillnaden mellan genknockout och knockdown.

Referens:

1.Shaffer, Catherine. "Gene Knockout kontra Knockdown." News-Medical.net, 12 februari 2018. Tillgänglig här  
2. "Gene Knockout." Nature News, Nature Publishing Group. Tillgänglig här

Image Courtesy:

1.'Knockout Mice5006-300'By Maggie Bartlett, NHGRI. (Public Domain) via Commons Wikimedia 
2.RNAi-simplified'By Matzke MA, Matzke AJM (2004) plantera frön av en ny paradigm. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC BY 2,5) via Commons Wikimedia