Vad är den strukturella skillnaden mellan ATP och dATP

De huvudsakliga strukturella skillnaden mellan ATP och dATP är det ATP är en ribonukleotid under dATP är en deoxiribonukleotid. Det betyder; ATPs sockergrupp är ribos, som innehåller en hydroxylgrupp (-OH) i 2'-positionen, medan sockergruppen av dATP är deoxiribos, som inte innehåller sådan hydroxylgrupp i 2'-positionen. Följaktligen tjänar ATP som cellens energimarginal medan dATP tjänar som en av de fyra nukleotidprekursorerna för DNA-syntes. 

ATP och dATP är två typer av adenin nukleotider som finns i cellen. Båda består av en adeninbas och tre fosfatgrupper bundna till pentosockret. 

Viktiga områden som omfattas 

1. Vad är strukturen hos ATP
     - Definition, struktur, roll i cellen
2. Vad är strukturen för dATP
     - Definition, struktur, roll i cellen
3. Vad är strukturella likheter mellan ATP och dATP
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är den strukturella skillnaden mellan ATP och dATP
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp 

ATP (adenosintrifosfat), dATP (deoxiadenosintrifosfat), deoxiribos, 2'OH, Ribose 

Vad är strukturen hos ATP 

ATP (adenosintrifosfat) är en ribonukleotid, som tjänar som cellens energimarginal. Strukturvis är kvävebasen, fosfatgrupperna och ett pentosocker de tre komponenterna i en nukleotid. I ATP är adenin den kvävebaserade basen, som fäster till 1'-positionen av pentosockret. Vidare innehåller ATP tre fosforylgrupper bundna till 5-stället för pentosockret. 

Figur 1: ATP-struktur 

Den första fosfatgruppen vid pentosockret är alfa-fosfatgruppen; den andra är beta medan den tredje eller den terminala fosfatgruppen är gamma. Här är beta- och gamma-fosfatgrupperna högfosfatfosfatgrupper. 

Vad är strukturen för dATP 

dATP (deoxiadenosintrifosfat) är en deoxiribonukleotid, som tjänar som en föregångare för DNA-syntes. Samma som ATP är de tre strukturella komponenterna av dATP adeninbasen, fosfatgrupperna och pentosockret. Här bifogas adeninbasen till 1'-positionen för pentosockret. Men pentosockret i dATP är deoxiribos. Den består inte av en 2'hydroxylgrupp. Endast 3'-läget innehåller en hydroxylgrupp, som också uppträder i ribosockret.

Figur 2: dATP-struktur

De tre fosfatgrupperna, alfa, beta och gamma fäster också 5'-positionen av deoxiribosocker.  

Strukturella likheter mellan ATP och dATP 

  • ATP och dATP är två typer av adeninukleotider. 
  • De består av en adeninbas och tre fosfatgrupper bundna till pentosockret. 

Strukturell skillnad mellan ATP och dATP 

Definition 

ATP avser den fosforylerade nukleotiden som komposerar adenosin och tre fosfatgrupper och förser energi för många biokemiska, cellulära processer, särskilt för ADP, genom att genomgå enzymatisk hydrolys. DATP avser däremot en av de två purinukleotiderna som används för att syntetisera DNA. 

Pentosocker 

ATP består av ett ribosocker medan dATP består av ett deoxiribosocker. Och detta medför den huvudsakliga strukturella skillnaden mellan ATP och dATP.

2 'Position 

2'-ställningen för ribos av ATP består av en hydroxylgrupp medan 2'-positionen för deoxiribos av dATP består av ett väte. Därför är detta också en viktig strukturell skillnad mellan ATP och dATP.

Typ  

ATP är en ribonukleotid medan dATP är en deoxiribonukleotid. 

Roll i cellen 

ATP fungerar som cellens energimarginal medan dATP fungerar som en föregångare för DNA-syntes. 

Slutsats 

ATP är en ribonukleotid vars pentosocker är en ribos. Därför består den av en 2'-hydroxylgrupp i pentosockret. Å andra sidan är dATP en deoxiribonukleotid, vars pentosocker är en deoxiribos, som inte består av en 2'-hydroxylgrupp. Följaktligen är den huvudsakliga strukturella skillnaden mellan ATP och dATP närvaron av en 2'-hydroxylgrupp i pentosockret.

Referens:

1. "Adenosintrifosfat." National Center for Biotechnology Information. PubChem Compound Database, U.S. National Library of Medicine, tillgängligt här
2. "2'-deoxidadenosintrifosfat." National Center for Biotechnology Information. PubChem Compound Database, U.S. National Library of Medicine, Tillgänglig här

Image Courtesy:

1. "ATP-kemisk struktur" (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia     
2. "DATP-kemisk struktur" (Public Domain) via Commons Wikimedia