Vad är skillnaden mellan mikrosatellit och minisatellit

De huvudskillnad mellan mikrosatellit och minisatellit är det den upprepande enheten hos en mikrosatellit består av 2-6 baspar medan den upprepande enheten i en minisatellit består av 10-100 baspar. Vidare innehåller en mikrosatellituppsättning 5-200 upprepningar medan en minisatellituppsättning innehåller 10-1 500 upprepningar.

Mikrosatellit och minisatellit är två typer av repetitivt DNA i genomet. Huvudanvändningen av mikrosatellit DNA är för DNA-fingeravtryck, medan minisatelliterna är för faderskapstestning som de förekommer i familjegrupper.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är Microsatellite
     - Definition, struktur, betydelse
2. Vad är Minisatellite
     - Definition, struktur, betydelse
3. Vad är likheterna mellan mikrosatellit och minisatellit
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan mikrosatellit och minisatellit
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp

DNA-fingeravtryck, mikrosatellit, minisatellit, faderskapstestning, repetitivt DNA

Vad är Microsatellite

En mikrosatellit är en repeterande sekvens av 2-6 baspar i genomet. Eftersom det är en typ av tandemupprepningar med korta sekvenser av nukleotider är även mikroselliterna kända som korta tandemrepetitioner (STRs). Upprepningarna av enkla nukleotider kallas enkel nukleotidpolymorfism (SNP). Vidare sker mikrosatelliter genom genomet. I det humana genomet uppträder dinukleotidrepetitionerna i varje 30 000 baspar.

Figur 1: Faderskapsanalys

Dessutom är mikrosatelliter en starkt mutativ region i genomet. Den huvudsakliga metoden för att förvärva mutationer är genom DNA-slipning under replikering. Unika mikrosatellitsekvenser förekommer inom familjer. Därför använder vi analysen av mikrosatelliter för faderskapstestning. Vidare orsakar förlängningen av trinucleotidmikrosatellitrepetat svåra humana störningar som Fragile X syndrom och Huntingtons sjukdom.

Vad är en Minisatellite

Minisatellit är en repeterande sekvens av 10-100 baspar i genomet. Här är den upprepande enheten något stor och den kallas a DNA-motiv. Ett annat namn för minisatellit är variabla antal tandemrepetitioner (VNTRs). Antalet VNTRs är mycket varierande bland individer. Den repetitiva enheten i en minisatellit är GC-rik.

Figur 2: Minisatelliter

På grund av minisatellites mycket varierande karaktär bland individer använder forskare dem för DNA-fingeravtryck. De använder också minisatelliter som genetiska markörer under länkanalysen. Vissa minisatellit-sekvenser är involverade i bildandet av ras-onkogenassocierad cancer.

Likheter mellan mikrosatellit och minisatellit

• Mikrosatellit och minisatellit är två typer av höggradigt repetitivt DNA som består av tandemrepetationer i det eukaryota genomet.
• Även om de inte har någon tilldelad funktion i genomet, är de viktiga för att upprätthålla genomets struktur.
• Även dessa DNA-sekvenser förekommer inte i de intergena regionerna. Därför är de icke-kodande DNA.
• Dessutom kan båda användas vid identifiering av individer.
• Vissa av dem kan vara associerade med sjukdomar.
• De verkar som små, mörka band i CsCl densitetsgradientanalys.

Skillnad mellan mikrosatellit och minisatellit

Definition

Mikrosatellit hänför sig till en uppsättning korta upprepade DNA-sekvenser vid ett bestämt locus på en kromosom, som varierar i antal hos olika individer och kan sålunda användas för genetisk fingeravtryck medan minisatellit avser en form av polymorf DNA innefattande ett varierande antal tandemreceptioner , med upprepade enheter upp till cirka 100 nukleotider i längd. Detta är den grundläggande skillnaden mellan mikrosatellit och minisatellit.

Typ av Tandem Repeats

Mikrosatelliter är STR medan minisatelliter är VNTR.

Förekomst

Dessutom uppträder mikrosatelliter huvudsakligen genom genomet, medan minisatelliter huvudsakligen uppträder vid ändarna av genomet.

Upprepningsenhetens storlek

Storleken på den upprepande enheten hos en mikrosatellit är 2-6 baspar medan storleken på den upprepande enheten av en minisatellit är 10-100 baspar. Detta är en stor skillnad mellan mikrosatellit och minisatellit.

Antal upprepningar per genom

En särskild repeterande enhet uppträder omkring 5-200 gånger i genomet i mikrosatelliter medan en särskild repeterande enhet uppträder 10-1 500 gånger i minisatelliter.

Storleken på arrayen

En annan skillnad mellan mikrosatellit och minisatellit är att storleken på arrayen av upprepande enheter är 10-1000 baspar i mikrosatelliter medan storleken på arrayen av upprepande enheter är 0,5-15 kb i mikrosatelliter. 

Arrayets komplexitet

Mängden mikrosatelliter är huvudsakligen homogen medan mängden minisatelliter är heterogen.

Slutsats

Mikrosatellit är en typ av repetitivt DNA i det eukaryota genomet med en 2-6 baspar långa repetitiva sekvenser. De är utbredd genom genomet och kan användas för faderskapstestning. Å andra sidan är minisatellit en typ av repetitivt DNA med 10-100 baspar långa repetitiva sekvenser. De förekommer huvudsakligen i slutet av kromosomerna och kan användas för DNA-fingeravtryck. Sålunda är den huvudsakliga skillnaden mellan mikrosatellit och minisatellit deras struktur och betydelse.

Referens:

1. Ramel, C. "Mini- och Microsatellites." Miljöhälsoperspektiv105.Suppl 4 (1997): 781-789. Tillgänglig här

Image Courtesy:

1. "Stages of Gene Fingerprinting" Av Sneptunebear16 - Egent arbete (CC BY-SA 4.0) via Wikimedia Commons  
2. "VNTRexample" Av Madelyndotson - Egent arbete (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia