Hur man hittar Aminosyra Sequence

Vad är Aminosyra

Aminosyror är de grundläggande byggstenarna i alla proteiner i vår kropp. Kan det vara ett hormon, ett enzym, ett strukturellt protein som keratin, alla dessa består av aminosyror. Aminosyror polymeriserar för att producera proteiner. Eftersom varje aminosyra har en basisk -NH2-ände och en sur -COOH-ände, reagerar dessa terminaler med varandra och gör en kedja av aminosyror som kallas en polypeptid. En polypeptid kan innehålla en mängd aminosyror. Beroende på ordningen av aminosyror, även känd som aminosyrasekvensen, kan proteiner skilja sig från varandra. Sekvenseringen är av yttersta vikt eftersom det avgör om proteinet fungerar ordentligt eller inte.

Aminosyror polymeriserar inte slumpmässigt. Denna process är högt reglerad. Koden för varje protein lagras i en DNA-sekvens som först transkriberas till en m-RNA-sekvens (i högre organismer DNA spliceras före omvandling till m-RNA där de oönskade DNA-sekvenserna som ligger i mellan gener avlägsnas) och sedan m- RNA är översatt till en aminosyrasekvens. 

(A = adenin, T = tymin, G = guanin, C = cytosin, U = Uracil i m-RNA t ersätts med U)

Om vi ​​betraktar DNA som ett fyrbokstavs alfabet och det kan göra tre bokstavsord kallas dessa tre bokstavsord Codons. Var och en av dessa kodoner står för en viss aminosyra. Om en DNA-sekvens eller m-RNA-sekvens tillhandahålls kan vi därför förutsäga aminosyrasekvensen. Den verkliga frågan är eftersom DNA är en linjär uppsättning information vi borde ha några regler att börja och stanna i rätt läge.

Få steg för att hitta aminosyrasekvensen

• STEG 1  - Vet vilken DNA-sträng som ges. Det finns två strängar: Kodningssträng eller icke-kodande sträng.

 

Man kan antingen läsa kodningssträngen från 3 'till 5' eller läsa mallsträngen från 5 'till 3' när man gör motsvarande m-RNA-sträng.

• STEG 2 - Skriv motsvarande m-RNA-sträng.

Använda kodningssträng: (A = U, T = A, G = C, C = G) Läs från vänster till höger

Använda mallsträng: (T = U) Läs från vänster till höger

Vi kan se att vi uppnår samma sekvens oberoende av vilken sträng som används.

• STEG 3 - Konvertera m-RNA som en sekvens av kodoner. Börja ALLTID från kodonet AUG och ALDRIG räkna samma nukleotid två gånger!

• STEG 4 - Använd tabellen nedan för att hitta den relevanta aminosyrasekvensen.

Kom också ihåg,
en. Startkodon AUG står för metionin.
b. Om du stöter på ett stoppkodon UAA, UGA, UAG bör du sluta sekvensering.

Kontrollera om du slutar med svaret nedan:

Met-Leu- Asp-Val-Phe-STOP