Skillnad mellan Ti och Ri Plasmid

Huvudskillnad - Ti vs Ri Plasmid

Agrobacterium arter är växtpatogener som inducerar olika sjukdomar i högre växter. Ti (tumörinducerande) och Ri (rotinducerande) plasmider är två typer av naturliga plasmider framställda av Agrobacterium arter. Ti-plasmider framställs av Agrobacterium tumefaciens medan Ri-plasmider produceras av Agrobacterium rhizogenes. Både Ti och Ri plasmider består av en del av plasmid-DNA som är känt som T-DNA som överförs till växtgenomet med hjälp av virulens (vir) gener. De huvudskillnad mellan Ti och Ri plasmiden är det Ti-plasmid inducerar tumör / krongall i dikotikum medan Ri-plasmiden inducerar håriga rötter. På grund av deras förmåga att infektera växter används både Ti och Ri plasmider i stor utsträckning som vektorer för att producera transgena växter.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är Ti Plasmid
     - Definition, struktur, vektorproduktion
2. Vad är Ri Plasmid
     - Definition, struktur, vektorbildning
3. Vad är likheterna mellan Ti och Ri Plasmid
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan Ti och Ri-plasmiden
    - Jämförelse av viktiga skillnader

Viktiga termer: Agrobacterium Arter, genetisk teknik, håriga rötter, Ri-plasmid (pri), T-DNA, Ti-plasmid (pTi), Tumör, för gener

Vad är Ti Plasmid

Ti-plasmiden hänför sig till en typ av plasmid av det som tillåter Agrobacterium tumefaciens att infektera växter, som producerar en tumör / krongalltumör. Således består Ti-plasmiden av både tumörbildande och virulens (vir) gener. De vir gener ansvarar för överföringen av T-DNA som innehåller de tumörbildande generna i växtgenomet genom excision och integration. En typisk Ti-plasmid består av fyra regioner: region A (T-DNA som är ansvarig för tumörbildning), region B (ansvarig för replikation), region C (ansvarig för konjugation) och region D (ansvarig för virulens). Generna i T-DNA-regionen kontrollerar produktionen av växttillväxthormoner (auxin och agropin), vilket inducerar proliferationen av de infekterade växtcellerna. Båda ändarna av T-DNA-regionen flankeras av en gränssekvens som innehåller direktsekvensupprepningar av 24 baspar. Bara den rätta gränsen är oumbärlig för T-DNA-överföring. Strukturen av Ti-plasmiden visas i Figur 1.

Figur 1: Ti-plasmid

I Agrobacterium-medierad transformering av gener, är vektorn designad baserat på Ti-Plasmid. Vektorn är sammansatt av T-DNA-gränssekvenser, vir gener och den modifierade T-DNA-regionen. Under modifikationen av T-DNA-regionen avlägsnas de gener som är ansvariga för tumörbildningen och ersätts av de främmande gener som ska transformeras. 

Vad är Ri Plasmid

Ri-plasmiden hänför sig till en typ av plasmid som tillåter Agrobacterium rhizogenes att infektera byxceller genom att producera håriga rötter. Den består av två T-DNA-fragment känd som Tr-DNA och T1-DNA. Båda fragmenten separeras av ett 15 kb DNA-segment. Tr-DNA liknar T-DNA-regionen hos Ti-plasmiden och innehåller gener som inducerar framställning av tillväxthormoner. T1-DNA-regionen består av fyra gener: Rola (ansvarig för bildandet av håriga rötter), rolB (inducerar rotinitiering och kallusbildning), rolC (främjar rottillväxt) och Rold (undertrycker callus tillväxt). Transformationen av T-DNA induceras av vir gener. Bildandet av håriga rötter av Agrobacterium rhizogenes visas i figur 2.

Figur 2: Håriga rötter

Ti-plasmider ersätts oftast av Ri-plasmider i genteknik.

Likheter mellan Ti och Ri Plasmid

• Ti och Ri plasmider är naturligt framställda av Agrobacterium.
• Båda typerna av plasmider orsakar sjukdomar i många dikotyledona växter.
• Både Ti och Ri plasmider överför en del av plasmid-DNA som är känt som T-DNA i växtgenomet med hjälp av virulens (vir) gener.
• Storleken på både Ti och Ri plasmider är omkring 200 kb.
• De regulatoriska sekvenserna hos några gener som finns i T-DNA hos båda plasmiderna känns igen av växtcellsmekanismerna.
• De andra generna i T-DNA består av prokaryota regulatoriska sekvenser.
• På grund av förmågan att infektera växtceller används både Ti och Ri plasmider i genteknik för att producera transgena växter.

Skillnad mellan Ti och Ri Plasmid

Definition

Ti-plasmid: Ti-plasmiden är en typ av plasmid av det som tillåter bakterierna att infektera växter som producerar en tumör / krongalltumör.

Ri-plasmid: Ri plasmid är en typ av plasmid som tillåter bakterier att infektera växtceller genom att producera håriga rötter.

Sorts Agrobacterium arter

Ti-plasmid: Ti-plasmiden produceras av Agrobacterium tumefaciens.

Ri-plasmid: Ri-plasmiden produceras av Agrobacterium rhizogenes.

Storlek

Ti-plasmid: Ti-plasmidens storlek är 180-205 kb.

Ri-plasmid: Storleken på Ri-plasmiden är 250 kb.

Typ av sjukdom

Ti-plasmid: Ti-plasmiden inducerar bildningen av krongall / tumör.

Ri-plasmid: Ri-plasmiden inducerar bildandet av håriga rötter.

Typ av studie

Ti-plasmid: Ti-plasmider undersöks mindre jämfört med Ri-plasmider.

Ri-plasmid: Ri-plasmider är väl undersökta.

Slutsats

Ti-plasmiden och Ri-plasmiden är två typer av plasmider som finns i olika Agrobacterium arter. Både Ti-plasmiderna och Ri-plasmiderna består av T-DNA och vir gener. Ti plasmider finns i Agrobacterium tumefaciens som inducerar bildandet av krongalltumör. Ri plasmider finns i Agrobacterium rhizogenes som inducerar bildandet av håriga rötter. Huvudskillnaden mellan Ti och Ri-plasmiden är den typ av sjukdom som orsakas av varje typ av plasmider.

Referens:

1. "Föreläsning 26: Ti och Ri Plasmider." NPTEL, IIT Guwahati, Tillgänglig här.
2.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Agrobacterium rhizhogenes och Ri Plasmid." Finns här.

Image Courtesy:

 1. "Ti plasmid" Av Mouagip - Egent arbete (CC0) via Commons Wikimedia
2. "Agrobacterium rhogenogenes" Av FruitDefendu - Egent arbete (CC BY-SA 3.0) via Wikimedia Commons