Mall och kodningsträng är de två termer som beskriver de två strängarna i dubbelsträngad DNA. Under transkription tjänar en av de två strängarna i dubbelsträngad DNA som mallsträngen. Mallsträngen löper i 3 'till 5' riktning. Den andra strängen i dubbelsträngad DNA, vilken sträcker sig från 5 'till 3' riktning är känd som kodningssträngen. Mallsträngen är ansvarig för aminosyrasekvensen vid syntetisering av polypeptidkedjan. De huvudskillnad mellan mall och kodningsträng är det mallsträngen tjänar endast som mall för transkription medan kodningssträng innehåller exakt samma sekvens av nukleotider i mRNA förutom tymin.
Den här artikeln tittar på,
1. Vad är Mall Strand
- Definition, egenskaper, struktur
2. Vad är kodning Strand
- Definition, egenskaper, struktur
3. Vad är skillnaden mellan Mall och kodning Strand
Mallsträngen är strängen som tjänar som mall för mRNA-syntesen under transkription. Vanligtvis adderar RNA-polymeras, vilket är enzymet involverat i transkriptionen av gener i mRNA, nukleotider i 5'-3'-riktningen till den växande strängen av mRNA. Därför bör mallsträngen riktas från 3 'till 5' för att tillsätta komplementära nukleotider till den växande mRNA-strängen i 5'-3'-riktningen. Följaktligen kan DNA-strängen, som består av 3'-5'-riktning i dubbelsträngad DNA, tjäna som mallsträng vid transkription. Det betyder att mallsträngen är DNA-strängen i dubbelsträngad DNA som är ansvarig för aminosyrasekvensen hos den syntetiserade polynukleotidkedjan. Den andra DNA-strängen i dubbelsträngad DNA kallas icke-mall. Mallsträngen kallas också antisenssträngen eller den positiva strängen.
Mallsträngen består av en sekvens av anti-kodoner som är nukleotid-tripletema som finns i tRNA individuellt. Antikodonet är komplementärt till kodoner i icke-mallen eller kodningssträngen. Den syntetiserande mRNA är temporärt fäst vid mallsträngen genom att bilda vätebindningar med de komplementära nukleotiderna i mallsträngen. RNA-polymeras tillsätter uracil som den komplementära nukleotiden till mRNA-strängen för adenin i mallsträngen i stället för tymin. Mallsträngen i transkriptionen visas i Figur 1.
Figur 1: Mall Strand
DNA-strängen som tjänar som icke-mallsträng under transkription kallas kodningssträngen. Transkription är långsträckt i 5'-3'-riktningen genom tillsats av komplementära nukleotider till mRNA-strängen. Kodningssträngen löper också från 5 'till 3' riktning. Följaktligen är kodningssträngen oförmögen att tjäna som mall under transkription. Den kodande strängen innehåller kodoner, vilka är nukleotidtripletema som specificerar en unik aminosyra i polypeptidkedjan. Dessa kodoner gör gemensamt den genetiska koden, som är en universell funktion i nästan alla levande former på jorden. Kodningssträng under transkriptionen visas i figur 2.
Figur 2: Kodningssträng i transkriptionen
Den kodande strängen innehåller samma nukleotidsekvens av mRNA-primära transkriptet. Därför bioinformatiska verktyg som GLIMMER och GeneMark, som är involverade i att finna gener i en viss DNA-sekvens, beroende på kodningssekvensen för att förutse gener i den specifika DNA-sekvensen. Eftersom kodningssträngen innehåller liknande sekvenser till mRNA, kan de unika sekvenserna i mRNA-liknande startkodon, stoppkodon och den öppna läsramen hittas i kodningssekvensen. Dessa egenskaper, tillsammans med promotorns sekvenser, kan användas av bioinformatikverktyg för att förutse gener genom Ab initio metod.
Mall Strand: Mallsträng är också känd som antisenssträng, icke-kodande sträng eller negativ sträng.
Kodande strand: Kodningssträng är också känd som antingen känslesträng, icke-mallsträng eller positiv sträng.
Mall Strand: Mallsträngen riktas i 5 'till 3' riktningen.
Kodande strand: Kodningssträngen riktas i 3 'till 5' riktningen.
Mall Strand: Mallsträngen transkriberas till mRNA.
Kodande strand: Kodningssträngen transkriberas inte till mRNA.
Mall Strand: Mallsträng innehåller den komplementära nukleotidsekvensen som mRNA.
Kodande strand: Kodningssträng innehåller samma nukleotidsekvens till mRNA, förutom tymin.
Mall Strand: Mallsträngen innehåller antikodoner.
Kodande strand: Kodningssträngen innehåller kodonerna.
Mall Strand: Vätebindningar bildas mellan mallsträngen och det syntetiserande mRNA, tillfälligt under transkription.
Kodande strand: Inga vätebindningar bildas mellan den kodande strängen och det syntetiserande mRNA under transkription.
Mall Strand: Mallsträng innehåller samma nukleotidsekvens som tRNA.
Kodande strand: Kodningssträng innehåller den komplementära nukleotidsekvensen som tRNA.
Den dubbelsträngade DNA-molekylen består av två DNA-strängar, som kallas mallsträng och kodningssträng. Mallsträngen tjänar som DNA-mallen för transkription, vilket är det första steget med genuttryck. RNA-polymeras adderar komplementära nukleotider till nukleotiderna som kodas i mallsträngen för att bilda det primära RNA-transkriptet. Tillsatsen av nukleotider sker i 5'-3'-riktningen. Därför bör mallsträngens riktning vara 3 'till 5'. Den icke-mall-DNA-strängen, vilken löper i 5'-3'-riktningen, kallas kodningssträngen eftersom den innehåller samma nukleotidsekvens i mRNA-strängen. Därför är huvudskillnaden mellan mall och kodningssträng deras förmåga att transkriberas av RNA-polymeraser.
Referens:
1. Alberts, Bruce. "Från DNA till RNA." Molecular Biology of the Cell. 4: e upplagan. U.S. National Library of Medicine, 01 jan 1970. Web. 23 mars 2017.
2. "Sense (molekylärbiologi)." Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22 mars 2017. Web. 23 mars 2017.
Image Courtesy:
1. "0324 DNA Translation and Codons" Av OpenStax - (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia
2. "Enkel transkriptionsförlängning1" Av Forluvoft - Egent arbete (Public Domain) via Commons Wikimedia