Skillnad mellan snRNA och snoRNA

Huvudskillnad - snRNA vs snoRNA

snRNA och snoRNA är två typer av små, icke-kodande RNA-molekyler som finns i cellen. Både snRNA och snoRNA är involverade i modifiering av RNA strax efter transkriptionen. SnRNA finns i splitsningsfragment och Cajal-kroppar i cellens kärna. Den fosforylerade adapteren för kärn export (PHAX) är inblandad i transporten av snRNA och snoRNA till verkningsstället i kärnan. De huvudskillnad mellan snRNA och snoRNA är det snRNA är involverad i den alternativa splitsningen av pre-mRNA-molekyler för bestämning av vilken sekvens som ska översättas till ett protein medan snoRNA är inblandad i modifiering av rRNA och tRNA, mRNA-redigering och genomprägling.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är snRNA
      - Definition, Funktioner, Funktion
2. Vad är snoRNA
      - Definition, Funktioner, Funktion
3. Vad är likheterna mellan snRNA och snoRNA
      - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan snRNA och snoRNA
      - Jämförelse av viktiga skillnader

Viktiga termer: Alternativ Splicing, Genome Imprinting, Modifiera rRNA, mRNA Redigering, Liten Nuclear RNA (SnRNA), Små Nukleolär RNA (SnoRNA), U-RNA

Vad är snRNA

Liten nukleär RNA (snRNA) är en typ av liten icke-kodande RNA, innefattande 80 till 350 nukleotider i molekylerna. SnRNA kallas också U-RNA och de kan hittas i klyvningsfragment och kärnkroppar i kärnan. SnRNA är en komponent av de lilla nukleära ribonukleoproteinerna (snRNPs), som bildar spliceosomen som styr splitsningen av pre-mRNA-molekyler under post-transkriptionella modifikationer. Eukaryotisk pre-mRNA består av både introner och exoner. Intronerna bör avlägsnas från sekvensen genom att splica exoner tillsammans.

Figur 1: RNA-splitsning

Den alternativa splitsningen i eukaryoter producerar olika sekvenser av mRNA, som bildar flera typer av proteiner. En spliceosome innehåller omkring 145 proteiner. Dessa proteiner spelar en roll i genuttryck i stället för splitsning. De fem typerna av snRNP är involverade i splitsning är U1, U2, U4, U5 och U6. U2 och U6 börjar splitsningen. Avlägsnandet av introner från pre-mRNA-molekyler uppnås baserat på tre sekvenser. De är en 5'-splitsningsplats, en grenpunkt och en 3'-splitsningsplats. Vanligtvis börjar introner med en GT och slutar med en AT. Den alternativa splitsningen uppnås genom komplementär basparning av en GT-plats med AT-platsen hos en annan intron. Runt 15% enpunkts-mutationer i pre-mRNA kan påverka splicingsprocessen. RNA-splitsningen visas i Figur 1. 

Vad är snoRNA

Liten nukleolär RNA (snoRNA) är den andra typen av liten icke-kodande RNA som är involverad i modifiering och behandling av rRNA och tRNA-prekursorer. SnoRNA: s huvudfunktion är mognad av rRNA under bildningen av ribosomen. SnoRNA är inblandad i mRNA-redigering och genomprägling också. SnoRNA kan vara 80 till 1000 nukleotider i längd i jäst.

Figur 2: Sekundär struktur av C / D-rutan snoRNA

Två typer av snoRNA kan identifieras baserat på de distinkta och evolutionärt konserverade sekvenselementen närvarande i varje snoRNA. De är C / D-rutan och H / ACA-boxen snoRNAs. C / D-rutan är involverad i 2'-O-metyleringen och H / ACA-lådan är involverad i pseudo-uridyleringen. Några av snoRNAs är allestädes närvarande, vissa är vävnadsspecifika, och de andra är imprinted. Den sekundära strukturen hos C / D-rutan snoRNA visas i figur 2. 

Likheter mellan snRNA och snoRNA

• snRNA och snoRNA är typer av små icke-kodande RNA i cellen.
• Både snRNA och snoRNA är involverade i modifiering av RNA inuti kärnan.
• Den fosforylerade adapteren för kärn export (PHAX) är involverad i transporten av varje snRNA och snoRNA till verkningsplatsen i kärnan.

Skillnad mellan snRNA och snoRNA

Definition

snRNA: snRNA är en klass av små RNA som finns i kärnan av eukaryoter, involverade i pre-mRNA-bearbetningen.

snoRNA: snoRNA är en typ av liten RNA, som styr de kemiska modifieringarna av rRNA och andra RNA som tRNA och snRNA.

Står för

snRNA: snRNA står för små kärnkrafts-RNA.

snoRNA: snoRNA står för liten nukleolär RNA.

Hittades i

snRNA: snRNA finns bara i eukaryoter.

snoRNA: snoRNA finns i både eukaryoter och archaea.

Storlek

snRNA: snRNA-molekylen är 80 till 350 nukleotider lång.

snoRNA: snoRNA är 80 till 1000 nukleotider i längd i jäst.

Fungera

snRNA: siRNA är inblandad i alternativa splitsningar i eukaryoter.

snoRNA: snoRNA är involverad i mRNA-redigering, modifiering av rRNA och tRNA och genomprägling.

Slutsats

snRNA och snoRNA är två typer av små, icke-kodande RNA som är involverade i behandlingen av prekursor-RNA. SnRNA är involverat i splitsningen av eukaryot mRNA under post-transkriptionella modifikationer. SnoRNA är involverad i mognad av rRNA och tRNA. Därför är huvudskillnaden mellan snRNA och snoRNA deras funktion i prekursor-RNA-bearbetningen.

Referens:

1. "SnRNAs krävs för splitsning." CELLS. N.p., n.d. Webb. Tillgänglig här. 24 juli 2017. 
2. "Eukaryotiska snoRNA: Ett paradigm för genuttrycksflexibilitet." ScienceDirect. N.p., n.d. Webb. Tillgänglig här. 24 juli 2017. 
3. "MER FUNKTIONELL RNA MOLECULES." GENETIK. N.p., n.d. Webb. Tillgänglig här. 24 juli 2017. 

Image Courtesy:

1. "RNA splicing diagram en" Av LadyofHats (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. "RF00071" - taget från Rfam-databasen (Public Domain) via Commons Wikimedia