Skillnad mellan valbar markör och reportergen

De huvudskillnad mellan selekterbar markör och reportergen är att selekterbar markör används för att skilja mellan transformanter och icke-transformanter medan reportergenen används för att mäta expressionsnivån av den transformerade genen. Vidare har selekterbar markörgen sin egen promotor medan uttrycket av reportergen regleras av promotorn hos den transformerade genen.

Valbar tillverkare och reportergen är två typer av gener som används för att analysera transformanter i de studier som producerar transgena organismer.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är en markeringsmarkör
     - Definition, Syfte, Exempel
2. Vad är en Reporter Gene
     - Definition, Syfte, Exempel
3. Vad är likheterna mellan valbar markör och reportergen
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan valbar markör och reportergen
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp

Genuttrycksanalys, gen av intresse, reportergen, selekterbar markör, transformanter

Vad är en markeringsmarkör

Valbar markör är en typ av markörgener som vanligtvis är placerade i plasmiden. Det transformeras till värdcellen med hjälp av plasmiden. Transformanterna som innehåller den selekterbara markören kan växa i motsvarande selekterbara medium. Men de icke-transformanterna, som saknar den selekterbara markören, kan inte växa i det valbara mediet. Detta betyder att genprodukten av den selekterbara markören blir valfaktorn för överlevnaden.

De tre grupperna av selekterbara markörer är antibiotiska resistensgener, antimetabolitmarkörgener och herbicidresistensgener. De mest använda väljbara markörerna är antibiotikaresistensgenen. Därför kan endast transformanterna växa i mediet, vilket innehåller motsvarande antibiotikum.

Valbar markör 

Figur 1: Roll av antibiotikaresistenta gener i molekylär kloning

Alla transformanter kan emellertid inte innehålla genen av intresse. Vissa transformanter kan bara ha vektorn med den selekterbara markören. Sekvenserings- eller genuttrycksanalys tillåter endast detektion av rekombinanter som har genen av intresse.

Vad är en Reporter Gene

Reportergen är en typ av markörgener som används för att kvantifiera genuttrycket. De är fusionerade med den reglerande sekvensen av genen av intresse. Bortsett från analysen av uttrycket av genen av intresse tillåter reportergener att studera funktionen av genreglerande element och effekten av transkriptionsfaktorer på genuttrycket. Reportergener är också viktiga vid identifieringen av det vävnadsspecifika eller vägspecifika genuttrycket.

Figur 2: Reportergenens roll

Grönt fluorescerande protein (GFP) och luciferas är den vanligaste typen av reportergener. GFP är ett glödande protein under UV-ljus. Närvaron av andra fluorescerande proteiner såsom röda och gula fluorescerande proteiner möjliggör identifiering av olika proteiner i samma system. Luciferas är ett enzym som katalyserar produktionen av gulgrönt eller blått ljus från substratet luciferin.

Likheter mellan selekterbar markör och reportergen

• Valbar markör och reportergen är två typer av markörgener som används för att analysera transformanter.
• De transformeras till värdorganismen tillsammans med genen av intresse.
• Båda typerna av reportergener är inte närvarande i värdcellen under normala förhållanden. Därför är de främmande för värdcellen.

Skillnad mellan Selectable Marker och Report Gene

Definition

Den selekterbara markören refererar till en gen vars uttryck gör det möjligt för en att identifiera celler som har transformerats eller transfekterats med en vektor innehållande markörgenen medan reportergenen hänför sig till en gen som används för att "märka" en annan gen eller DNA-sekvens av intresse, såsom en promotor.

Betydelse

Valbar markör hjälper till att skilja mellan transformanter och icke-transformanter medan reportergen hjälper till att mäta mängden uttryck av den transformerade genen.

Promotor

Den selekterbara markören har sin egen promotor medan reportergen regleras under promotorn för den transformerade genen.

Plats

Selekterbar tillverkare kan vara i plasmiden eller inom genkonstruktionen medan reportergen är mellan promotorn och genen av intresse.

Resultat

Transformerade celler med den selekterbara tillverkaren kan växa i det selekterbara mediet men den icke-transformerade kan inte växa eftersom de saknar den selekterbara markören medan mängden genprodukt i reportergenen beror på mängden framgångsrikt transformerade gener av intresse.

exempel

Antibiotikaresistensgener, antimetabolitmarkörgener och herbicidresistensgener är typerna av selekterbara markörer medan GFP och luciferas är några reportergener.

Slutsats

De selekterbara markörerna är markörgenerna som används för att screena transformanter i motsvarande selekterbara medium medan reportergenerna är markörgener för att mäta mängden expression. Huvudskillnaden mellan selekterbara markör- och reportergener är typen av screening.

Referens:

1. Jha, Nandkishor. "Selectable Marker Genes and Reporter Genes." Biologisk diskussion, 16 okt. 2015, tillgängligt här
2. "Reporter Gene Assays." Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, tillgänglig här

Image Courtesy:

1. "Steg för molekylär kloning" Av Alexpicardal97 - Egent arbete (CC BY-SA 4.0) via Wikimedia Commons 
2. "Reportergen" Av TransControl på en.wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia