Skillnad mellan cDNA och genomiskt DNA

Huvudskillnad - cDNA vs genomiskt DNA

Komplementärt DNA (cDNA) och genomiskt DNA är två typer av DNA-molekyler som används i forskningsexperimenten i molekylärbiologi. Både cDNA och genomiskt DNA består av DNA-nukleotider. cDNA produceras genom omvänd transkription av det extraherade RNA från vävnad. De typer av RNA som används för omvänd transkription kan vara totalt RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomalt RNA eller tRNA. Genomiskt DNA kan emellertid isoleras direkt från cellen. De huvudskillnad mellan cDNA och genomiskt DNA är det cDNA representerar transkriptomen hos en viss organism medan genom-DNA representerar genomet.

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är cDNA
     - Definition, Fakta, Roll
2. Vad är genomiskt DNA
     - Definition, Fakta, Roll
3. Vad är likheterna mellan cDNA och genomiskt DNA
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan cDNA och genomiskt DNA
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelord: Komplementärt DNA (cDNA), genom, genomiskt DNA (gDNA), omvänd transkription, RNA, transkriptom

Vad är cDNA

cDNA (komplementärt DNA) hänvisar till det syntetiska DNA vars bassekvenser är komplementära till DNA. Det produceras från omvänd transkription av RNA-mallar. Total RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomalt RNA eller tRNA kan användas för omvänt transkription. Omvänd transkriptas är enzymet som katalyserar reaktionen för att producera cDNA från RNA. Den omvända transkriptionen kopplad till PCR visas i Figur 1.

Figur 1: Omvänd transkription kopplad med PCR

cDNA används huvudsakligen vid kloning av eukaryota gener i de prokaryota genomen. Exoner består av den kodande regionen av proteiner. I eukaryoter avbryts den kodande regionen av introner. Under transkription kodas både introner och exoner i pre-mRNA. Men under mRNA-bearbetningen avlägsnas intronerna från mRNA, vilket producerar ett moget mRNA genom att splica exonerna tillsammans. Den totala mRNA för en organism kallas transkriptomen. Prokaryoter saknar emellertid mRNA-bearbetningsmekanismer. Således används mRNA för att syntetisera cDNA som endast innehåller proteinkodande regioner av genomet. Detta cDNA används för att klona gener i prokaryoter. cDNA produceras naturligt i retrovirus under omvandlingen av RNA-genomet i DNA.

Vad är genomiskt DNA

Genomiskt DNA (gDNA) hänvisar till den totala uppsättningen kromosomal DNA i genomet. Den totala uppsättningen gener av en viss organism hänvisas till dess genom. Emellertid är inte endast genen av genomet aktiva. De flesta grupper av organismer har liknande typer av genomiskt DNA inom gruppen. Genomet av organismen passeras från nästa generation till den andra. Generellt består genomerna av ett stort antal baspar. Som ett exempel består det mänskliga genomet av cirka 3 miljarder baspar. Kromosomerna av det humana genomet visas i figur 2.

Figur 2: Kromosomer av det humana genomet

De fyra typerna av sekvenser som finns i det genomiska DNAet är proteinkodande gener, tandemly upprepade gener, repetitivt DNA och spacer-DNA. Genomiskt DNA används i många experiment inom molekylärbiologi. Isoleringen av genomiskt DNA är lätt jämfört med framställning av cDNA. Genomiskt DNA kan användas som PCR-mallar, vid kloning, sekvensering, beredning av genomiska bibliotek, DNA-fingeravtryck, studier av genstrukturer och detektering av mutationer / abnormiteter.

Likheter mellan cDNA och genomiskt DNA

• cDNA och genomiskt DNA är två typer av DNA-molekyler som används i forskningsexperimenten i molekylärbiologi.
• Både cDNA och genomiskt DNA består av DNA-nukleotider.
• Både cDNA och genomiskt DNA består av en sockerfosfatskelett.
• Både cDNA och genomiskt DNA är dubbelsträngade molekyler.
• Både cDNA och genomiskt DNA är sammansatta av exoner.

Skillnad mellan cDNA och genomiskt DNA

Definition

cDNA: cDNA är det syntetiska DNA vars bassekvenser är komplementära till genomiskt DNA.

Genomiskt DNA: Genomiskt DNA är den totala uppsättningen kromosomal DNA i genomet.

Representera

cDNA: cDNA representerar transkriptomen.

Genomiskt DNA: DNA representerar genomet.

Syntetiserad / Utdrag från

cDNA: cDNA syntetiseras från omvänd transkription av olika typer av RNA.

Genomiskt DNA: Genomiskt DNA kan extraheras från befintliga genomer.

Innehåll

cDNA: cDNA består av exoner eller kodande regioner.

Genomiskt DNA: Genomiskt DNA består av kodande och icke-kodande sekvenser av en organism.

Kvantitet

cDNA: cDNA innehåller några baspar.

Genomiskt DNA: Genomiskt DNA innehåller ett stort antal baspar.

Använda sig av

cDNA: cDNA används för framställning av cDNA-bibliotek.

Genomiskt DNA: Genomiskt DNA kan användas för att producera genomiska bibliotek.

Slutsats

cDNA och genomiskt DNA är två typer av DNA-molekyler som används i olika typer av experiment i molekylärbiologi. cDNA syntetiseras från RNA och består bara av exoner. Därför representerar den transkriptomen hos en organism. Genomiskt DNA kan lätt extraheras från cellens kärna. Den består av både kodande och icke-kodande regioner. Det representerar genomet hos en viss organism. Huvudskillnaden mellan cDNA och genomiskt DNA är den typ av DNA som finns i varje typ av DNA-molekyler.

Referens:

1. "CDNA (kompletterande DNA)." Människa gener, tillgängligt här.
2. "GDNA - Genomiskt DNA | Advanced Analytical (AATI). "Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), Tillgänglig här.
3. "Genomisk DNA-isolering och applikationer." Scribd, tillgänglig här.

Image Courtesy:

1. "Omvänd transkriptionspolymeras kedjereaktion" Av Jpark623 - Egent arbete (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Människa genom till gener" (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia