Skillnad mellan infognings- och ersättningsvektorer

De nyckelskillnad mellan införings- och ersättningsvektorer är att införingsvektorn har förmågan att infoga måttliga längder av främmande DNA medan ersättningsvektor har förmågan att rymma större längder av främmande DNA.

Fagvektorer är de bakteriofager som används för kloning. Det finns två typer av fagvektorer; de är införingsvektor och ersättningsvektor. Även alla fagvektorer består av icke-väsentliga gener. Dessa gener måste emellertid avlägsnas från fag för att underlätta nya främmande DNA-insatser.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är Insertion Vectors
3. Vad är ersättningsvektorer
4. Likheter mellan infognings- och ersättningsvektorer
5. Jämförelse vid sida vid sida - Infoga vs ersättningsvektorer i tabellform
6. Sammanfattning

Vad är en infogningsvektor?

Först av allt är införingsvektor den enklaste formen av lambda-kloningsvektorer. Faktum är att det är en typ av fagvektor som har en unik restriktionsplats införd inom vektorgenomet vid positionen för valfritt DNA. Vidare förblir fagd DNA utan borttagning. Denna icke-avlägsnande av fag-DNA begränsar storleken på insatserna (främmande DNA) som skall klonas inuti vektorn. Vidare är dessa vektorer användbara vid cDNA-kloning och expression. GT10, GT11 och Zap är exempel på denna vektor.

Figur 01: Lambda Phage

Infogningsvektor består av en enda igenkänningsplats. Den primära funktionen hos denna vektor är att utveckla cDNA-bibliotek som härrör från eukaryota mRNA-sekvenser. Dessutom kan den bara rymma längder av främmande DNA som sträcker sig mellan 05-11 kb. Den har också en unik klyvningsplats för införandet av främmande DNA.

Vad är ersättningsvektorer?

Ersättningsvektor eller substitutionsvektor är en typ av fagvektor utvecklad från avlägsnandet av ett mittfyllnadsfragment-område av fag-DNA. Det önskade främmande DNA-insertet ersätter fag-DNA.

Figur 02: Ersättningsvektor

Ersättningsvektorer är viktiga för att skapa genomiska bibliotek som EMBL4 och Charon40. Dessa vektorer kan rymma en större längd av främmande DNA som sträcker sig mellan 08-24 kb längder. Fyllningsområdet består också av en gen som gör fagvektorn oanvändbar i en bakteriell värd.

Vad är likheterna mellan infognings- och ersättningsvektorer?

• Insertions- och ersättningsvektorer är fagvektorer.
• Båda vektorerna rymmer utländska DNA-insatser.
• De båda är användbara för att skapa DNA-bibliotek.

Vad är skillnaden mellan infognings- och ersättningsvektorer?

Insertion vs Replacement Vectors
Insertionsvektor är en typ av fagvektor som har en restriktionsplats införd inom faggenomet vid stället för valfritt DNA.	Ersättningsvektor är en typ av fagvektor som utvecklats från avlägsnandet av ett mellanfragmentfragment-område av fag-DNA
Storlek på infogningsfragment
05-11 kb längd	08-24 kb längd
Filler Fragment
Inget fyllmedelfragment	Fyllnadsfragmentet ersätts av ett främmande insats
Fungera
Viktigt att skapa cDNA-bibliotek	Viktigt vid skapande av genombibliotek
exempel
GT10, GT11 och Zap är exempel	EMBL4 och Charon40 är exempel
Cleavage Site
En unik klyvningsplats är närvarande	Cleavage webbplats innehåller gener som inte är nödvändiga för den lytiska cykeln

Sammanfattning - Insertion vs Replacement Vectors

Både insertions- och ersättningsvektorerna är två typer av fagvektorer. Båda vektorerna har restriktionsställen som underlättar upptagandet av nya främmande DNA-insatser. Insertionsvektorer är viktiga för att skapa cDNA-bibliotek, medan ersättningsvektorer är viktiga för att skapa genomiska bibliotek. Vidare rymmer insättningsvektorer DNA-insatser med en måttlig längd. Men ersättningsvektorer kan rymma högre längder av främmande DNA-insatser. Sammantaget är detta den viktigaste skillnaden mellan infognings- och ersättningsvektorer.

Referens:

1. Hasty, P, et al. "Effektiviteten av införandet mot ersättningsvektorinriktning varierar vid olika kromosomala lokaliteter." Molekylär och cellulär biologi, U.S. National Library of Medicine, dec 1994, Tillgänglig här.
2. "Lambda Insertion Vectors." Biologi 335 Föreläsningsanteckningar - Lambda-vektorer, Tillgänglig här.
3. "Replacement Vector." Ersättningsvektor - Molekylärbiologiens terminologi för ersättningsvektor - GenScript, Tillgänglig här.

Image Courtesy:

1. "Lambda phage" Av Lizanne Koch - eget arbete med ChemBioDraw (Public Domain) via Commons Wikimedia