Skillnad mellan generella och specifika transkriptionsfaktorer

Huvudskillnad - Allmänt vs specifika transkriptionsfaktorer
 

Transkriptionsfaktorer krävs av RNA-polymeras för att verka på DNA-mallsträngen vid syntetisering av mRNA. Det finns olika typer av transkriptionsfaktorer. Dessa transkriptionsfaktorer bildar ett komplex med DNA-strängen. De ändrar antingen bekräftelsen av mallsträngen eller ökar affiniteten hos RNA-polymerasenzymet mot mRNA-syntes i processen för kallad transkription. Det finns två huvudtyper av transkriptionsfaktorer. De är allmänna eller basala transkriptionsfaktorer och de specifika transkriptionsfaktorerna. De allmänna transkriptionsfaktorerna är de faktorer som används för att bilda förinitieringskomplexet under transkriptionsprocessen. De är närvarande i nästan alla eukaryoter, och i prokaryoter bildar de ett mindre komplicerat komplex. De specifika transkriptionsfaktorerna är antingen förstärkare eller repressorer, vilka är specifika DNA-sekvenser som aktiverar eller undertrycker den allmänna transkriptionsprocessen. Vissa specifika transkriptionsfaktorer kan förändra själva DNA-sekvensen. De nyckelskillnad mellan de allmänna transkriptionsfaktorerna och de specifika transkriptionsfaktorerna är baserad på funktionaliteten. Allmänna transkriptionsfaktorer är involverade i bildandet av ett förinitieringskomplex av transkriptionsprocessen, medan specifika transkriptionsfaktorer deltar i att antingen aktivera eller undertrycka transkriptionsprocessen.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är allmänna transkriptionsfaktorer
3. Vad är specifika transkriptionsfaktorer
4. Likheter mellan generella och specifika transkriptionsfaktorer
5. Jämförelse vid sida vid sida - Allmänt mot specifika transkriptionsfaktorer i tabellform
6. Sammanfattning

Vad är allmänna transkriptionsfaktorer?

Allmänna eller Basala transkriptionsfaktorer är de faktorer som är involverade i bildandet av initieringskomplexet under transkription. De är viktiga för transkriptionsprocessen, och de spelar en viktig roll i den framgångsrika transkriptionen. Det finns sex viktiga generella transkriptionsfaktorer. Dom är; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF och TFIIA. De spelar olika roller under bildandet av initieringskomplexet.

1. TFIID - Denna transkriptionsfaktor (TF) är involverad i igenkänning av promotorsekvensen (TATA-boxen).
2. TFIIB - Promotorn / TFIID-komplexet är igenkänt av TFIIB. Detta ger en signal för bindningen av det huvudsakliga katalyserande enzymet RNA-polymeras.
3. TFIIF - Denna transkriptionsfaktor är bunden till RNA-polymeraset. TFIIF deltar således i processen genom att rekrytera RNA-polymeraset till rätt plats.
4. TFIIE och TFIIH - Bindningen av dessa transkriptionsfaktorer markerar slutet på bildandet av förinitiationen. Bindning av dessa ökar effektiviteten vid bildandet av pre-initieringskomplexet.
5. TFIIA främjar bindningen av TFIID till TATA-rutan.

Figur 01: Allmänna transkriptionsfaktorer

De ovan nämnda allmänna transkriptionsfaktorerna är specifika för RNA-polymeras II, vilket är typen av RNA-polymeras som förlänger mRNA-strängen. Det finns generella transkriptionsfaktorer involverade med RNA-polymeras I och III. Allmänna transkriptionsfaktorer kan också skilja sig beroende på typen av cell till vilken den verkar.

Vad är specifika transkriptionsfaktorer?

Specifika transkriptionsfaktorer är regioner som också ligger i DNA-sekvenserna. De är oftast antingen förstärkare eller repressorer. Specifika transkriptionsfaktorer är de specifika cis-verkande elementen i mall-DNA-strängen som genomgår transkription. Aktivering av dessa specifika förstärkare och repressorer medverkar i att öka enzymets affinitet genom att ändra orienteringen av DNA-molekylen eller genom att fungera som signalerande regioner. Specifika transkriptionsfaktorer används också för att inducera modifieringar av DNA-mallsträngen. Dessa modifikationer involverar huvudsakligen kovalenta modifieringar såsom metylering. Därmed fungerar metylerade DNA-regioner som speciella förstärkare eller repressorer av transkriptionsprocessen.

Figur 02: Specifika transkriptionsfaktorer

De specifika transkriptionsfaktorerna beror på typen av art och finns inte vanligen i alla eukaryoter. Dessa transkriptionsfaktorer aktiveras genom olika metaboliska tillstånd via signaltransduktionsvägar. Vid aktivering reglerar de uttrycket av genen på transkriptionsnivå.

Vad är likheterna mellan generella och specifika transkriptionsfaktorer?

• Båda faktorerna krävs vid transkriptionsprocessen.
• Båda faktorerna påverkar genuttrycket av en organism.
• Båda faktorerna bidrar till att reglera funktionen av RNA-polymeras i transkriptionsprocessen.
• Båda faktorerna finns främst i eukaryoter.

Vad är skillnaden mellan generella och specifika transkriptionsfaktorer?

General vs Specifik transkription
De allmänna transkriptionsfaktorerna är de faktorer som används för att bilda förinitieringskomplexet under transkriptionsprocessen.	De specifika transkriptionsfaktorerna är antingen förstärkare eller repressorer, vilka är specifika DNA-sekvenser som aktiverar eller undertrycker den allmänna transkriptionsprocessen.
Typ av molekyl
Allmänna transkriptionsfaktorer är proteinbaserade.	Specifika transkriptionsfaktorer är nukleotidsekvenser.
Bildning
Allmänna transkriptionsfaktorer bildar förinitieringskomplexet under transkriptionsinitieringen.	Specifika transkriptionsfaktorer fungerar som förstärkare eller repressorer för transkription.
typer
Det finns sex huvudtyper; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE och TFIIA av generella transkriptionsfaktorer.	Specifika transkriptionsfaktorer kategoriseras huvudsakligen som förstärkare och repressorer.

Sammanfattning - Allmänt vs specifika transkriptionsfaktorer

Transkriptionsfaktorer är viktiga för transkriptionsreglering och krävs för ökad effektivitet och noggrannhet i processen. Transkriptionsfaktorer är två huvudtyper; Allmän / Basal och Specifik. Allmänna transkriptionsfaktorer är involverade i bildandet av förinitieringskomplexet under transkription, medan specifika transkriptionsfaktorer är regioner i själva DNA som fungerar som förstärkare eller repressorer. Allmänna transkriptionsfaktorer är proteinbaserade och krävs av alla eukaryoter. Det varierar inte i stor utsträckning och förblir som likformiga molekyler. En specifik transkriptionsfaktor kan variera mycket och beror på individernas genetiska smink. Detta är skillnaden mellan allmänna och specifika transkriptionsfaktorer.

Ladda ner PDF-versionen av General vs Specific Transcription Factors

Du kan hämta PDF-versionen av den här artikeln och använda den för offlineändamål enligt citationsnotat. Vänligen ladda ner PDF-versionen här Skillnaden mellan generella och specifika transkriptionsfaktorer

Referens:

1.Pulverer, Bernd. "Sekvensspecifika DNA-bindande transkriptionsfaktorer." Nature News, Nature Publishing Group. Tillgänglig här 
2. "Transkriptionsfaktorer - Genspecifika faktorer differentierar ökat transkriptionspriser." DNA, binda, promotor och bindningar - JRank-artiklar. Tillgänglig här  
3. Orphanides, G, et al. "De allmänna transkriptionsfaktorerna för RNA-polymeras II." Genes & Development, Cold Spring Harbor Lab. Tillgänglig här  

Image Courtesy:

1.'Preinitiation complex 'Av ArneLH - eget arbete, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia  
2.'Role av transkriptionsfaktor i genuttrycksreglering 'Av Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Kombinationssystem Biologi av cancer Chapman & Hall / CRC Matematisk & Beräkningsbiologi, 2012, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia