Skillnad mellan eukaryotiska och prokaryota promotorer

Huvudskillnad - Eukaryotisk jämfört med prokaryotiska promotorer
 

Transkription är processen att omvandla den genetiska informationen som lagras i den kodande DNA-sekvensen till mRNA-sekvensen. En specifik DNA-region belägen vid 5'-änden av transkriptionsenheten initierar denna process. Den regionen är känd som promotorområdet. Dessa promotorer hittas typiskt intill transkriptionsstartplatsen. Längden på en promotor varierar från 100 bp till 1000 bp. Promotorerna är olika beroende på typorganismen. Eukaryotiska och prokaryota promotorer skiljer sig från varandra. I prokaryoter återfinns endast tre typer av promotorsekvenser nämligen -10 promotors, -35 promotor och uppströmselement. I eukaryoter, Det finns många olika promotorelement som TATA-box, initiatorelement, GC-box, CAAT-box, etc.. Det här är nyckelskillnad mellan eukaryota och prokaryota promotorer.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är eukaryotiska promotorer
3. Vad är prokaryotiska promotorer
4. Likheter mellan eukaryotiska och prokaryota promotorer
5. Jämförelse vid sida vid sida - Eukaryotiska kontra prokaryotiska promotorer i tabellform
6. Sammanfattning

Vad är eukaryotiska promotorer?

Tre huvuddelar; kärnpromotor, proximal promotor och distal promotor bildar kollektivt en promotor. I samband med eukaryoter finns det många antal promotorelement som är mycket sofistikerade och mer mångsidiga än promotorer. Det har visat sig att DNA, på grund av denna komplexitet hos de eukaryota promotorerna, har förmågan att vikas tillbaka på sig själv. Detta förklarar också det faktum att effekten av många regulatoriska sekvenser äger rum trots att de ligger många kilobaser bort från transkriptionsstället. Dessa eukaryota promotorer har förmågan att spänna genom ett brett spektrum av DNA-sekvenser.

Figur 01: Eukaryotisk promotor

Exempel på några eukaryota promotorer är Pribnow-boxen (TATA-boxen), GC-boxen, CAAT-boxen etc. I samband med TATA-boxen, det är en sekvens av 5 '- TATAA -3' som är närvarande i kärnpromotorregionen. Till TATA-rutan är transkriptionsfaktorproteiner och histonproteiner bundna. Bindningen av transkriptionsfaktorproteiner till TATA-rutan bidrar till bindningen av RNA-polymeras, vilket sedan resulterar i bildandet av transkriptionskomplex. I enkla termer kommer bindningen av dessa proteiner att driva transkriptionsprocessen. Denna process kommer att hämmas när histonproteiner blir bundna till TATA-rutan. Därför är TATA-rutan ett viktigt promotorelement som involverar i reglering av hastigheten för eukaryotisk transkription.

Vad är prokaryotiska promotorer?

I prokaryota organismer identifieras promotorn som involverar vid transkription av den associerade faktorn kallad sigma-faktor. Sigma-faktorer är unika för olika promotorsekvenser. Därför sägs att varje enskild sigma-faktor skulle känna igen en enda kärnpromotor-sekvens. Detta är en unik egenskap som förekommer i den prokaryota transkriptionsprocessen. Både RNA-polymeras och sigmafaktorn identifierar kollektivt den korrekta promotorregionen och bildar transkriptionskomplexet.

Den prokaryota promotorn innehåller endast tre typer av promotorelement. Den mindre involveringen av promotorelement i prokaryoter är den främsta anledningen till att deras transkriptionsprocess är mindre sofistikerad jämfört med eukaryotisk transkription som involverar ett högre antal promotorsekvenser. Av de tre promotorelementen i prokaryoter finns det två huvudsakliga två korta DNA-sekvenser. Dessa sekvenser klassificeras enligt deras plats. De är -10 promotorer eller element (som är närvarande 10bp uppströms transkriptionsstartställe), -35-promotorer eller -element (som är närvarande 35bp uppströms transkriptionsstartställe).

Figur 02: Prokaryotisk promotor

10-promotorn motsvarar den eukaryota TATA-boxen eller Pribnow-lådan och är en väsentlig komponent för initiering av transkription i prokaryoter. 35-promotorn består av en sekvens som är TTGACA som aktivt involverar i reglering av hastigheten av prokaryotisk transkription.

Vad är likheterna mellan eukaryotiska och prokaryota promotorer?

  • I båda typerna styrs promotorerna genom olika DNA-regulatoriska sekvenser som innefattar förstärkare, lyddämpare, isolatorer och gränselement.
  • Promotorer är de sekvenser som initierar transkription i prokaryoter och eukaryoter.
  • Promotorer är DNA-sekvenser.

Vad är skillnaden mellan eukaryotiska och prokaryota promotorer?

Eukaryotiska vs Prokaryotiska Promotorer

Eukaryotiska promotorer är de regulatoriska sekvenserna som initierar transkriptionen av eukaryota organismer. Prokaryota promotorer är de regulatoriska sekvenserna som initierar transkriptionen av prokaryota gener.
 element
Prokaryotisk promotor består av uppströmselement, -10 element och -35 element. Eukaryotisk promotor består av Pribnow box (TATA box), CAAT box, GC box och initiatorelement.

Sammanfattning - Eukaryotisk jämfört med prokaryotiska promotorer

En promotor är en region av DNA som involverar initiering av processen som kallas transkription. Dessa promotorer finns typiskt uppströms för transkriptionsstartplatsen. De tre huvuddelarna som bildar en promotor är kärnpromotor, proximal promotor och distal promotor. I samband med eukaryoter finns det många antal främjande element i promotorområdet som är mycket sofistikerade och mer mångsidiga än prokaryoter. Exempel på några eukaryotiska promotorelement är Pribnow-boxen (TATA-boxen), GC-boxen, CAAT-boxen etc. I prokaryoter finns två viktiga promotorelement, nämligen -10 element (som är närvarande 10bp uppströms transkriptionsstart) (som är närvarande 35bp uppströms transkriptionsstartplats). -10-promotorn initierar transkriptionen och -35-promotorn reglerar transkription. Båda typerna av promotorer styrs av olika DNA-regulatoriska sekvenser som innefattar förstärkare, silencers, isolatorer och gränselement. Detta är skillnaden mellan eukaryota och prokaryota promotorer.

Ladda ner PDF av Eukaryotic vs Prokaryotic Promoters

Du kan ladda ner PDF-versionen av den här artikeln och använda den för offline-ändamål enligt citationsnotat. Var god ladda ner PDF-versionen här: Skillnad mellan eukaryotisk och prokaryotisk promotor

Referens:

1.Kanhere, A. "Strukturella egenskaper hos promotorer: likheter och skillnader mellan prokaryoter och eukaryoter." Nucleic Acids Research, vol. 33, nr. 10, Feb. 2005, sid. 3165-3175., Doi: 10,1093 / nar / gki627.
2. "Promoters." Addgene. Tillgänglig här 

Image Courtesy:

1.'Gene struktur eukaryote 2 annoterade 'Av Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). "Eukaryotisk och prokaryotisk genstruktur". WikiJournal of Medicine 4 (1). DOI: 10,15347 / WJM / 2017,002. ISSN 20024436., (CC BY 4,0) via Commons Wikimedia
2.'Figure 15 02 01 'By CNX OpenStax, (CC BY 4,0) via Commons Wikimedia