Skillnad mellan Cosmid och Phagemid

De nyckelskillnad mellan Cosmid och Phagemid är på vilken typ av sekvenser den innehåller. En Cosmid innehåller en cos-plats och en plasmid. Därför är det en hybridvektor medan en Phagemid är en plasmid som innehåller ett F1-replikationsställe från F1-fagen.

Kosmider och fagmider används för kloningsändamål, speciellt för att klona större fragment av DNA. Dessa används i stor utsträckning speciellt i kloningsgener som ansvarar för framställning av olika proteiner. Kosmider och fagmider replikeras antingen ensamma som plasmider eller förpackas i virala partiklar och replikeras därefter.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är en Cosmid
3. Vad är en fagemid
4. Likheter mellan Cosmid och Phagemid
5. Jämförelse vid sida vid sida - Cosmid vs Phagemid i tabellform
6. Sammanfattning

Vad är en Cosmid?

En kosmid, refererad som en hybridplasmid, innefattar cos-ställen extraherade från Lambda-fagpartiklar och en plasmid. Dessa cos-ställen är långa fragment av DNA med 200 baspar. Följaktligen har de sammanhängande eller klibbiga ändar som tillåter plasmiden att passa in i viralt DNA. Därför är cos-ställena viktiga för förpackning av DNA.

Det finns tre cos platser;

• cosN-plats - involverad i nicking av DNA-strängen genom terminaktivitet
• cosB-plats - engagerad i att hålla terminalen.
• cosQ-platsen - involverad i att förhindra nedbrytningen av DNA genom DNaser.

Figur 01: Cosmid

Cosmids kan också antingen replikera enkelsträngat DNA eller dubbelsträngat DNA med användning av ett lämpligt replikationsstart. Kosmider innehåller vanligtvis antibiotikaresistensgen som markörer för selektion av transformanter. Således kan användningen av en kosmid som en vektor underlätta kloningen, och restriktionsenzym-digestionen av vektorn kan sedan extrahera dessa fragment.

Vad är en fagemid (fasmid)?

Fagemid, även betecknad som fasmid, är en typ av hybridvektor också. Fagemid innehåller ett speciellt replikationsställe som kallas f1-ursprunget för replikation. F1-ursprunget för replikation extraherar från en fl-fag.

Fagemid kan replikera både enkelsträngat och dubbelsträngat DNA. Replikation kan antingen äga rum som en plasmid medan den genomgår oberoende replikation eller kan packas in i fagpartiklar och slutligen infektera bakteriell värd E coli. Vid infektion av E coli celler, kräver f1-fagen närvaron av en pilus. Kön pili är därför viktiga under in vitro förpackning av fagemider.

Vad är likheterna mellan Cosmid och Phagemid?

• Både Cosmid och Phagemid är kloningsvektorer som används i rekombinant DNA-teknik.
• Cosmid och Phagemid kan replikera enkelsträngad och dubbelsträngad DNA.
• Båda kan genomgå oberoende replikation liknande plasmider.
• Cosmid och Phagemid kan genomgå in vitro förpackning och infektera bakterieceller.
• Både Cosmid och Phagemid kräver ett lämpligt replikationsstart för kloning.

Vad är skillnaden mellan Cosmid och Phagemid?

Cosmid vs Phagemid
Cosmid är en hybridvektor som innehåller en cos-plats och en plasmid.	Fagemid är en plasmid som innehåller ett F1-ursprunget för replikation av F1-fagen.
Närvaro av Cos Sites
Cos platser finns närvarande i kosmid och är nödvändiga för in vitro-förpackning.	Cos platser är frånvarande i fagemid.
Förekomst av F1 Ursprungetes ursprung
I kosmid kan fi-replikets ursprung vara eller inte kunna presenteras.	F1-replikets ursprung är närvarande i fagemid.
Förekomst av antibiotikaresistenta gener
Antibiotikaresistenta gener är närvarande i kosmider för att identifiera transformanterna från icke-transformanter.	Antibiotikaresistenta gener är frånvarande i fagmider.
Krav på In Vitro Packaging
Kräver en cos-plats.	Kräver en sex pilus.

Sammanfattning - Cosmid vs fagemid

Cosmid och Phagemid är kloningsvektorer som används i rekombinant DNA-teknik. Kosmider är hybridvektorer som innehåller speciella klibbiga ändar som kallas cos-platser. in vitro Förpackningar kräver dessa cos-platser. Medan fagmider är plasmider som innehåller ett fl upphörande replikation extraherat från fl-fag. Både kosmid och fagemid kan genomgå oberoende replikation eller in vitro förpackning till bakterieceller. Dessa är viktiga skillnader mellan kosmid och fagemid.

Referens:

1.Qi, H, et al. "Fagemidvektorer för Phage Display: Egenskaper, egenskaper och konstruktion." Journal of Molecular Biology., U.S. National Library of Medicine, 30 mars 2012. Tillgänglig här 
2. Collins, J och B Hohn. "Cosmids: en typ av plasmidgenkloningvektor som är förpackningsbar i Vitro i bakterieofag-Lambda-huvuden". Förlopp från National Academy of Sciences i USA, U.S. National Library of Medicine, september 1978. Tillgänglig här  

Image Courtesy:

1.'Cosmid (engelska) 'Av Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia