Skillnad mellan uppströms och nedströms DNA

Huvudskillnad - Upstream vs Downstream DNA
 

Det är viktigt att ha generell kunskap om DNA-kompositionen och strukturen för att förstå skillnaden mellan uppströms och nedströms DNA. DNA består av polynukleotidkedjor. Nukleotider är byggstenarna som skapar polynukleotidkedjor och varje nukleotid är tillverkad av tre komponenter: ett fem-kolsocker, en kvävebas och en fosfatgrupp. En fosfatgrupp och en OH-grupp är fästa vid 5'-position-kol och 3'-positionskol av sockermolekylen i en nukleotid. Nukleotider sammanfogas av fosfodiesterbindningar som bildas mellan 5'-fosfatgruppen av en nukleotid och 3'-OH-grupp hos den intilliggande nukleotiden. Om en polynukleotidkedja har en fri 5'-fosfatgrupp tilldelas den som 5'-änden; om den har en fri 3'-OH-grupp, tilldelas den som en 3'-ände. Därför har DNA-strängar vanligen 5'- och 3'-ändar i enlighet med polynukleotidkedjans slutpositioner. DNA existerar också som dubbelsträngad form. Två strängar är antiparallella mot varandra. Därför har DNA två strängar som går i riktning mot 5 'till 3' och 3 'till 5'. Uppströms och nedströms DNA refereras med hänvisning till transkription och syntes av 5 'till 3' mRNA-sträng. Om DNA anses mot 5 slutet av kodningssträngen från transkriptionsinitiationsstället är det känt som uppströms DNA. Om DNA anses mot 3'-änden från kodningssträngen från transkriptionsinitieringsstället är känt som nedströms DNA. Detta är nyckelfaktorn mellan uppströms och nedströms DNA.

INNEHÅLL
1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är Upstream DNA
3. Vad är Downstream DNA
4. Jämförelse vid sida vid sida - Upstream vs Downstream DNA
5. Sammanfattning

Vad är Upstream DNA?

En gen är en strukturell och funktionell enhet härdighet som ligger på DNA från en organism. Den lagras med instruktioner för att konstruera ett protein. Genen har en specifik region i en DNA-molekyl. Vid behov transcriberas och translateras det till ett protein via syntes av en mRNA-sträng. Normalt löper en kodande sträng av genen från 5 'till 3' riktning. När den transkriberas producerar den en mRNA-sträng i samma riktning 5 'till 3'. Under transkriptionen betjänas 3 'till 5' antisenssträng som mallsträngen och initierar mRNA-syntesen. Det finns en transkriptionsinitieringsplats i genen. Med hänvisning till transkriptionsinitiationsstället är DNA-regionen mot 5'-änden av den kodande strängen känd som uppströms DNA. En promotor av genen är normalt belägen i uppströmsregionen av DNA. I eukaryotiska gener finns det TATA-lådor, proximalprojektorer, och förstärkare i området uppströms genen. Uppströmsregionen av genen hänvisas till negativa tal. Uppströms DNA av en gen är av yttersta vikt för transkriptionen.

Vad är Downstream DNA?

Transkriptionsinitieringsplatsen är känd som en punkt av en gen. DNA-regionen från +1 pekar mot 3'-änden av kodningssträngen är känd som nedströms-DNA. Med andra ord ligger nedströms genen från transkriptionsinitiationsstället mot 5 'änden av mallsträngen. Därför innefattar nedströms DNA i en genregion transkriptionsenhet och andra sekvenser såsom terminatorsekvens. Promotorn kan påverka nedströmsekvensen hos en gen. Nedströmsdelen av en gen hänvisas till positiva tal. Nedströms DNA av en gen är den faktiska regionen som ger proteinprodukten.

Figur 01: Uppströms och nedströms DNA

Vad är skillnaden mellan Upstream och Downstream DNA?

Uppströms mot nedströms DNA
DNA-regionen mot 5'-änden av den kodande sekvensen från transkriptionsinitiationsstället är känt som uppströms DNA.	DNA-regionen mot 3'-änden av kodningssträngen från transkriptionsinitieringsstället är känd som nedströms DNA.
element
Promotorer och förstärkare är placerade på uppströms DNA	Transkriptionsenheten och terminatorsekvenserna är belägna i nedströms-DNA.
Numrering
Nukleotider i uppströmsregionen hänvisas med negativa tal	Nukleotider refereras med positiva tal.
Fungera
Denna region innehåller element som är nödvändiga för att reglera och initiera transkription	Denna region innehåller instruktioner för att producera ett protein och avsluta transkriptionen

Sammanfattning - Upstream vs Downstream DNA

Det är lätt att identifiera uppströms och nedströms om en RNA-sträng. Med avseende på referensstället är regionen mot 5'-änden av RNA-strängen känd som uppströms-RNA medan regionen mot 3'-änden är känd som nedströms-RNA. I DNA finns emellertid två strängar som löper i båda riktningarna 5 'till 3' och 3 'till 5'. Därför är skillnaden mellan uppströms och nedströms DNA komplicerat. Därför differentieras den med hänvisning till transkriptionen av en gen. Från transkriptionsinitiationsstället mot 5-änden av känslighetssträngen är DNA-regionen känt som uppströms-DNA, medan från transkriptionsinitiationsstället mot 3'-änden av känslesträngen är känd som nedströms-DNA. Detta är skillnaden mellan uppströms och nedströms DNA.

referenser:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi och Jonatha M. Gott. "Distinkta roller för sekvenser uppströms och nedströms från Physarumediting sites." RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, september 2009. Web. 18 mars 2017

Image Courtesy:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro och Luísa Romão. "Gene Expression Regulation genom uppströms öppna läsramar och mänsklig sjukdom." PLOS Genetics. Public Library of Science, n.d. Webb. 18 mars 2017.