Skillnad mellan målinriktad och oriktad proteomik

Den viktigaste skillnaden mellan riktade och icke-riktade proteomiker är att riktade proteomik syftar till mätning av överflödet av ett specifikt protein, medan oriktad proteomik inte riktar sig mot ett specifikt protein.

Proteomics är den omfattande studien av proteiner, deras strukturer och funktioner. Det studerar hela proteinkomplementet i en cell, vävnad eller en organism under specifika förhållanden. Det finns två typer av proteomik som riktade proteomik och ojämn proteomik.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är Targeted Proteomics
3. Vad är oriktad proteomik
4. Likheter mellan målinriktad och oriktad proteomik
5. Jämförelse vid sida vid sida - Målad mot obestämd proteomik i tabellform
6. Sammanfattning

Vad är Targeted Proteomics?

Som namnet indikerar riktar sig målmedicinska proteomikum ett specifikt protein eller en peptid i en komplex blandning av proteiner för analys. Därefter analyseras närvaron och kvantiteten av det förutvalda specifika proteinet. Denna metod är möjlig för endast ett prov eller över flera prov. Denna metod är lämplig även för en specifik grupp av proteiner. Det resulterar i mer exakta, kvantitativa och känsliga data. Dessutom ger masspektrometri kopplad till riktade proteomics mer exakta tillförlitliga mätningar. Denna metod använder triple quadrupole masspektrometer (QQQ) för dess analys.

Figur 01: Proteomics

Målad proteomik är en lämplig metod om du vill verifiera om ett knockdown-mål faktiskt slås ner eller när du vill kvantifiera ett visst protein / peptid i blodserum, cerebral vätska eller i celllysat etc. Du kan också använda den om du vill för att kontrollera om ett visst protein är differentiellt uttryckt över prov eller under ett tidskursexperiment.

Vad är oriktad proteomik?

Oriktad proteomik, som namnet nämner, riktar sig inte mot ett specifikt protein eller en peptid för dess analys. Discovery proteomics är ett annat namn för oriktad proteomik. Det är faktiskt en mer "global" analys. I allmänhet är det att svara på frågan "vilket protein eller proteiner finns i detta prov eller multipelprover?". Denna metod är inte känslig som riktad proteomik. Men det kan identifiera och mäta många proteiner inklusive nya proteiner. Oriktad proteomik kan producera både kvantitativa och kvalitativa mätningar.

Vad är likheterna mellan målinriktade och icke-riktade proteiner?

• Både riktade och obestämda proteomika mäter proteiner i prover.
• De är viktiga i proteomanalys.
• Dessa metoder använder masspektrometri.

Vad är skillnaden mellan målinriktad och oriktad proteomik?

För det första är målmedvetet proteomik bestämning av närvaron och kvantiteten av ett visst protein eller en peptid i en komplex blandning av proteiner. I motsats till detta är icke-inriktad proteomik den kvantitativa och kvalitativa studien av proteiner närvarande i ett prov eller prover utan att rikta ett visst protein. Målad proteomik utförs med förutvalda eller riktade proteiner, medan oriktad proteomik utförs för att ta reda på typerna av proteiner i detta prov. Dessutom är riktade proteomics känsligare än icke-riktade proteomics.

Sammanfattning - Målat mot oriktad proteomik

Sammanfattningsvis är riktade och obestämda proteomik två typer av proteinstudier. Som deras namn antyder riktade proteomik mot ett specifikt protein, medan icke-riktade proteomik inte riktar sig mot ett specifikt protein. Detta är skillnaden mellan riktade och obestämda proteomikum.

Referens:

1. "Targeted Proteomics." UC Davis Proteomics Core, Tillgänglig här.
2. "Proteomics / Introduction to Proteomics." Musikteori / Modes - Wikibooks, öppna böcker för en öppen värld, Tillgänglig här.

Image Courtesy:

1. "Proteomics" Av Xxl7441 på engelska Wikibooks - Överförd från en.wikibooks till Commons (Public Domain) via Commons Wikimedia