Skillnad mellan motiv och domän

De nyckelskillnad mellan motiv och domän är att motivet är inte självständigt stabilt medan domänen är oberoende stabil.

Proteiner är viktiga biologiska makromolekyler som finns i vår kropp. Å andra sidan bestämmer genens genetiska kod en proteins aminosyrasekvens. Dessutom har proteiner primära, sekundära och tertiära strukturer. Den primära strukturen är aminosyrasekvensen för polypeptidkedjan. När polypeptidkedjor viks med varandra bildar den den sekundära strukturen av proteinet. Alfa-heliker, betongark och sekundärstrukturer hör till de sekundära strukturerna. Vissa grupper av super-sekundära element är kända som proteinmotiv. Den tertiära strukturen hos ett protein hänför sig till dess tredimensionella struktur som bestämmer proteinets funktion. Domän är en vikad sektion av en proteinmolekyl, som är globulär och har en diskret funktion. Det är proteins grundläggande funktionella och tredimensionella struktur.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är Motif
3. Vad är Domain
4. Likheter mellan motiv och domän
5. Jämförelse vid sida vid sida - Motiv vs domän i tabellform
6. Sammanfattning

Vad är Motif?

Motiv är en viss gruppering av de super sekundära elementen av proteiner, såsom alfa helixer och beta strukturer. De är några slags mönster som finns i olika proteiner. Motiv beskriver de sekundära strukturelementens vikningsmönster och deras interaktioner. Dessa vikningsmönster stabiliseras av liknande kopplingar som är närvarande i tertiära strukturer. Men de är inte lika komplexa som tertiära strukturer.

Figur 01: Motiv

De är enkla kombinationer av sekundära strukturer av proteiner. Motiv är inte stabil i sig. Dessutom förklarar motiven strukturen hos ett protein men förutspår inte proteinets funktion. Exempel på proteinmotiv är ett beta-alfa-beta-motiv, grekiskt nyckelmotiv, Beta-fat, Beta-meander-motiv, etc.

Vad är Domain?

Domän är en grundläggande, funktionell och tredimensionell enhet av ett protein. Det utför en viss funktion. Ett enda protein kan ha flera distinkta domäner. Varje domän är en oberoende enhet. Det är en globulär struktur. Det ansvarar för en specifik funktion eller interaktion. Domäner kan användas för att hypotesera funktionen av ett okarakteriserat protein. Vid analys av ett protein är det viktigt att ta hänsyn till eftersom domänerna är proteinets funktionella enheter.

Figur 02: Tre olika domäner av pyruvatkinas

Domäner är mycket stabila och kompakta strukturer. De kan enkelt skilja sig från andra regioner. Pyruvatkinas har tre skillnadsdomäner, såsom visas i figur 02. Domänens längd kan variera och medellängden är 100 aminosyror. Varje domän innehåller en hydrofob kärna byggd från sekundära strukturella enheter. Flera domäner gör tillsammans en tertiär struktur av ett protein.

Vad är likheterna mellan motiv och domän?

• Motiv och domän är enheter närvarande i proteinmolekyler själva.
• De är användbara vid klassificering av proteinfamiljer.

Vad är skillnaden mellan motiv och domän?

Motiv är en viss gruppering av de super sekundära elementen av proteiner, såsom alfa helixer och beta strukturer medan domänen är den funktionella enheten av ett protein. Dessutom är motivet en sekundär struktur medan domänen är ansvarig för proteinets tertiära struktur. Dessutom är domänen en oberoende enhet, till skillnad från ett motiv. Domänen visar också funktionen av ett protein medan motivet inte är. Det här är de viktigaste skillnaderna mellan motiv och domän. Nedan infographic presenterar skillnaden mellan motiv och domän i tabellform.

Sammanfattning - Motiv vs Domän

Motiv är ett arrangemang av sekundära strukturer av proteinmolekylen. Det är vanligtvis inte stabilt i sig, till skillnad från en domän. Domän är en självständigt stabil struktur av ett protein. Därför kan det vara en del eller helproteinmolekyl. Det är en tredimensionell grundläggande funktionell enhet av proteinet. Dessutom har den en funktion, och det är en oberoende enhet. Motiv kan vara en del av domänen. Men domän kan inte vara en del av ett motiv. Detta är skillnaden mellan motiv och domän.

Referens:

1. "Protein Domain." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31 juli 2018. Tillgänglig här

Image Courtesy:

1. "Miljötoxinprotein nyckelmotiv" Genom NatelewisDerivative arbete (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Pyruvate kinase protein domäner" Av Thomas Splettstoesser - Egent arbete, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia