Skillnad mellan aktiv webbplats och bindande webbplats

De nyckelskillnad mellan aktiv plats och bindningsplats är det en aktiv plats hjälper katalysen av en kemisk reaktion, medan en bindningsplats hjälper till vid bindning av en ligand till en stor molekyl.

En bindningsplats är en region på ett protein, DNA eller RNA, till vilket en ligand kan binda. Enzymer är proteiner. En aktiv plats är en region på ett enzym som substraten kan binda för att genomgå en kemisk reaktion. Denna specifika region har också en bindningsplats tillsammans med en katalytisk plats. Därför bidrar bindningsställen endast vid bindning av en ligand till en stor molekyl, medan aktiva ställen hjälper både bindningen av en ligand till en stor molekyl samtidigt som den låter den genomgå en katalyserad kemisk reaktion.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är Active Site
3. Vad är bindande webbplats
4. Jämförelse vid sida vid sida - Aktiv plats vs bindande plats i tabellform
5. Sammanfattning

Vad är Active Site?

Den aktiva platsen är en region på ett enzym till vilket substraten för en kemisk reaktion binder för att genomgå en katalyserad kemisk reaktion. denna region består av två delregioner som bindningsställe och katalytisk plats. Bindningssidan innehåller några rester som kan hjälpa bindningen av substratet (reaktanter) till enzymet. Den katalytiska platsen hjälper till att katalysera den kemiska reaktionen. Dessutom är denna region mycket liten jämfört med hela volymen av enzymet; ungefär 10-20% av hela volymen av enzymet.

Figur 01: Bindningsplatsen och katalytiska webbplatsen för en aktiv webbplats

Vanligtvis innehåller den aktiva platsen 3-4 aminosyror. resten av aminosyrorna i enzymet involverade i upprätthållandet av enzymets tertiära struktur. Ännu viktigare är att en aktiv plats har en specifik design som passar till ett specifikt substrat. Därför reagerar dessa enzymer med endast särskilda substrat. Men ibland behöver enzymer kofaktorer för deras funktion. Huvudfunktionen hos den aktiva platsen är att reducera aktiveringsenergin för en kemisk reaktion för att därigenom öka reaktionshastigheten.

Vad är bindande webbplats?

Bindningsstället är en region på ett protein, DNA eller RNA, till vilket ligander kan binda. Där kan liganden bilda en kemisk bindning med denna sida. Dessa regioner visar specificitet; en särskild ligand binder till en viss bindningsplats. Därför är denna webbplats ett mått på de typer av ligander som kan binda med en molekyl.

Dessutom brukar vi ofta använda dessa regioner för funktionell karakterisering av biomolekyler. Till exempel kan vi karakterisera funktionaliteten hos en aktiv webbplats via dess bindande webbplats. Vidare är, i fallet med DNA, den specifika typen av bindningsstället transkriptionsfaktorbindningsstället närvarande på DNA: n.

Vad är skillnaden mellan aktiv webbplats och bindande webbplats?

Aktiv plats är en region på ett enzym till vilket substraten för en kemisk reaktion binder för att genomgå en katalyserad kemisk reaktion, medan bindningsstället är en region på ett protein, DNA eller RNA, till vilket ligander kan binda. Detta är nyckelfaktorn mellan aktiv plats och bindningsplats. Dessutom är de aktiva ställena närvarande på enzymer och de bidrar till att öka reaktionshastigheten för en viss kemisk reaktion genom att minska aktiveringsenergibarriären för den reaktionen. Bindningsställen å andra sidan är ansvariga för bindningen av en specifik ligand med en viss molekyl.

Nedan infographic presenterar skillnaden mellan aktiv plats och bindningsplats i tabellform.

Sammanfattning - Active Site vs Binding Site

Aktiva ställen är regioner på enzymer som kan öka reaktionshastigheten för en kemisk reaktion genom att reducera aktiveringsenergibarriären för den reaktionen. En bindningsplats är vilken region som en ligand kan binda till. Aktiv plats innehåller också en bindningsplats. Skillnaden mellan aktiv plats och bindningsställen ligger på existensen och funktionaliteten. Därför är nyckelskillnaden mellan aktiv plats och bindningsplats att en aktiv plats hjälper katalysaten av en kemisk reaktion, medan en bindningsplats hjälper till vid bindning av en ligand till en stor molekyl.

Referens:

1. "Active Site." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 24 juli 2018. Tillgänglig här 
2. "Bindningssida". Wikipedia, Wikimedia Foundation, 28 aug 2018. Tillgänglig här 

Image Courtesy:

1. "Enzymstruktur" Av Thomas Shafee - eget arbete, (CC BY 4,0) via Commons Wikimedia