De tre indiska medicinska systemen är Siddha, Ayurveda och Unani. Siddha medicinska system praktiseras huvudsakligen i södra indiska staten Tamil Nadu. Men vissa utövare säger att det finns en nord indisk skola med Siddha medicin också som utvecklats i Himalaya. Siddha var populär i antika Indien och antas vara det äldsta medicinska systemet i världen. Systemet utvecklades av "Siddhars" som skulle vara heliga med andliga krafter i antika Indien. De hade fått kunskapen från hinduiska gud Lord Shiva och hinduiska gudinnan Lord Shiva och gudinna Parvathi.
Indiska skrifter säger att det var 18 huvudsakliga "Siddhars" och av dem var Agasthiyar fadern till Siddha Medicinal System. Siddha-systemet bygger på förutsättningen att endast en hälsosam kropp kan bidra till att utveckla en hälsosam själ, så gamla utövare reglerade sitt liv med intensiva yogiska övningar, fasta, meditation och uppnådda supermakter, inklusive miraklet att bota sjukdomar. Siddha medicin "hemligheter" skrevs på palmblad manuskript från vilka systemet utvecklades som det praktiseras idag i Indien.
Ayurveda är å andra sidan relaterad till Vediska perioden i Indien och dess traditionella medicinska hemligheter hittades i Sushruta Samhita och Charaka Samhita. Utövare tror att ayurveda kombinerar den kunskap som finns i de fyra vedaerna och förebyggande av sjukdom är viktigare med en korrekt anpassning av ens livsstil till årstiderna.
Både Siddha och Ayurveda känner igen att sjukdomen orsakas av obalansen hos de tre humörerna. Men Siddha ser humörernas dominans som vatham, pitham och kapam i barndom, vuxen ålder och ålderdom, medan Ayurveda ser kapamens dominans i barndomen, vatham i ålderdom och pitham i vuxen ålder!.
Ayurveda fokuserar på fem element av jord, vatten, eld, luft och eter som påverkar blodet, kyle, kött, snabb, benmärg och sperma. Ayurveda attributar också upplevelser av mänskligt liv som 20 "gunas" eller kvaliteter. Det använder kirurgi, yoga, meditation och massage tekniker. Siddha fokuserar på sju element saram (plasma) för tillväxt, cheneer (blod) för näring av muskler, ooun (muskel) för kroppsform, kollzuppu (fettvävnad) för oljebalans och smörjning av leder, enbu (ben) för kroppshållning, moolai (nerv) för styrka och sukila (semen) för reproduktion.