Skillnad mellan transposon och retrotransposon

Transposon vs Retrotransposon

Transposoner och retrotransposoner är DNA-genetiska komponenter, och det finns stora skillnader mellan dem. Procentandelen närvaron av dessa genetiska material varierar mellan olika arter, och deras funktioner bestämmer organismens öde med mutationer och andra fenotypiskt viktiga förändringar. Transposoner och retrotransposoner är gener eller samlingar av vissa gener som ligger i DNA-strängarna, och förändringar av deras platser har varit huvudorsakerna för dessa konsekvenser. Emellertid avser denna artikel att diskutera dessa geners funktioner kort och presenterar en jämförelse mellan transposoner och retrotransposoner.

Vad är Transposon?

Transposoner är intressanta fragment eller segment av DNA med förmågan att förändra DNA-strängens position i form av klipp- och klistermekanism. På grund av denna mobila natur av transposonerna är dessa kända som hoppande gener. Transposoner är av två huvudtyper som kallas klass I transposoner och klass II transposoner. Vanligtvis kallas klass II-typen som transposonerna och klass I-typen hänvisas till som retrotransposonerna. Processerna för skärning och klistring av mobila DNA-segment regleras av enzymetransposas. Enzymet binder till transposons båda ändar och skär DNA-strandens fosfodiesterbindningar, isolerar transposonet, flyttar det till målplatsen och binder på den nya platsen. Emellertid är denna process intressant att förstå, eftersom vissa transposoner bara kan flytta till vissa platser bara på grund av inkompatibiliteten hos bassekvenserna med målplatsen. Gener med ena änden av en enda sträng har samma bassekvens med den andra änden av den andra ensträngen transposoner med klibbiga kanter, eftersom de kan binda till målen DNA-strängens ställen med samma bassekvens som i de klibbiga ändarna . Men denna rörlighet hos gener kan orsaka förändringar av genotypen såväl som i fenotypen av organismen. Forskare som uppfann transposonerna och genetiskt modifierade livsmedel och organismer enligt de föredragna anpassningarna gjordes sedan. Högproduktiva jordbruksgrödor, antibiotika med medicinska egenskaper, boskapsdjur var några av de fördelaktigt utvecklade produkterna efter uppfinningen av transposoner av Barbara McClintock på 1940-talet.

Vad är Retrotransposon?

Retrotransposoner är klass I-transposonerna, och dessa rör sig genom genomet genom mekanismen för kopiering och pasta. Mekanismen för retrotransposons rörlighet involverar få stora steg såsom kopiering av gensegmentet av DNA-strängen i RNA, överföring av kopian av RNA till målplatsen, transkription av RNA-sekvensen tillbaka till DNA med användning av omvänt transkriptas och införande av genen till den nya platsen för DNA-sträng av genom. De båda ändarna av dessa retrotransposoner har vanligtvis långa terminala upprepningar med ca 1000 baspar, och de används som identifieringsegenskaper hos dessa gener. Dessa gener förstärks lätt inuti genomet, och andelen av retrotransposonerna i det humana genomet är omkring 50%. Dessa kan vara ganska farliga eftersom orsakssystemet av AIDS, HIV och T-cell leukemivirus har retrotransposonerna i sina RNA-genomer. Faktum är att dessa virus kan binda retrotransposonerna till vilken som helst plats i de humana DNA-strängarna med användning av omvänt transkriptas och integrase. Integrasenzymet fungerar på samma sätt som transposas i klass II transposoner.