Skillnad mellan lophotrochozoa och ecdysozoa, de två stora bilaterier, diskuteras i denna artikel. Baserat på de senaste studierna som använde kärn- och mitokondriala DNA-sekvenser, reviderade forskare taxonomin för Animal Kingdom. Enligt de nya molekylära fylogenierna identifierar forskare deutersomes som en separat naturlig grupp. Dessutom är den stora gruppen av protostomer uppdelad i två monofyletiska bilaterala grupper som heter Lophotrochozoa och Ecdysozoa. Djurriket består nu av tre stora monofyletiska klader av bilaterala djur. lophotrochozoa, ecdysozoa och deuterstomia. Kladedueterostomin delas vidare in i två undergrupper; (a) ambulakrari, som innefattar tagghudingar, och (b) ackord, som innefattar urokordater, cefalokordater och ryggradsdjur. Lophotrochozoa och ecdysozoa är vidare indelade i fler och fler undergrupper baserat på deras molekylära fylogenier.
De karakteristiska egenskaperna hos gruppens lophotrochozoa är närvaron av a trochofore larver och en matningsstruktur kallad lofofor. Dock har endast få lophotrochozoaner båda dessa karakteristiska egenskaper. Lophotrochozoans reproduceras sexuellt genom att frisätta deras gameter i miljön. Sexuell reproduktion är också vanligt i denna kategori. Varje medlem i denna grupp är triploblastisk och visar bilateral symmetri. Både markbundna och vattenlevande arter finns i denna grupp. Lophotrochozoa är indelad i sex undergrupper; (a) Flatworms (Platyhelminthes, som inkluderar turbellarians, trematoder och cestoder), b) Nemertaner (bandmaskar), Mollusks (chitoner, snäckor som sniglar, sniglar, nudibranchs, musslor som musslor och ostron, bläckfiskar som squids och bläckfisk ), c) Annelider (polychaeter som sandmaskar och tubormar, oligokareter inklusive regnmaskar och sötvattnormar, hirudinider, som inkluderar leeches), d) Lophophorater (grenodlar, foronider och bryozoaner) och e) Rotifera (hjuldjur).
Namnet ecdysozoan ges till denna grupp av djur på grund av förekomsten av ett särskilt steroidhormon som kallas ecdysteroider, som styr processen som kallas ecdysis eller metamorfos. Ecdysozoans har ett cutikulärt skelett och kan kasta skelettet genom ekdöd. De flesta medlemmarna i denna grupp har separata könen. Under sexuell reproduktion sänker manar spermier inuti kvinnans kropp. Många ekdysozoaner är ensamma arter, medan vissa arter lever i kolonier. Vissa arter visar asexuell reproduktion genom parthenogenes.
De viktigaste undergrupperna av ekdysozoan inkluderar nematodas (rundormer), onychophoraner (sammetormar), tardigrader ("vattenbjörnar") och artropoder. Phylum Arthropoda är den största gruppen med högsta antal arter och består huvudsakligen av myriapoder (tusenpinnar, millipeder), chelicerater (hästskorskrabbor, araknider), kräftdjur (hummer, krabbor, kalkar, copepoder) och hexapoder (insekter).
• Ekdysozoaner har förmågan att kasta sin exoskelett flera gånger under hela sin livslängd, medan lophotrochozoan är de djur som har en trochoforlarver och en matningsstruktur kallad lophophore.
• I motsats till lophotrochozoan har ekdysozoaner ett speciellt steroidhormon som kallas ecdysteroider.
• Ekdysozoa inkluderar nematoder, artropoder, onykophoraner och tardigrader, medan lophotrochozoan inkluderar flatmaskar, nemeraner, mollusker, annelider, lophophorat och rotifer.